46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4326 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3911  Fusaric acid resistance protein conserved region  98.98 
 
 		 683 aa  1388    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4545  multidrug efflux system protein MdtO  98.24 
 
 		 683 aa  1382    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3946  multidrug efflux system protein MdtO  98.68 
 
 		 683 aa  1386    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03953  predicted multidrug efflux system component  98.98 
 
 		 683 aa  1387    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4638  multidrug efflux system protein MdtO  99.12 
 
 		 683 aa  1390    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4326  multidrug efflux system protein MdtO  100 
 
 		 683 aa  1399    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5589  multidrug efflux system protein MdtO  98.68 
 
 		 683 aa  1385    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03913  hypothetical protein  98.98 
 
 		 683 aa  1387    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6555  multidrug efflux system protein MdtO  35.97 
 
 		 708 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  28.66 
 
 		 633 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.66 
 
 		 633 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0194  fusaric acid resistance protein region  38.62 
 
 		 660 aa  148  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  26.3 
 
 		 665 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3974  fusaric acid resistance protein region  26.84 
 
 		 720 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  23.35 
 
 		 663 aa  140  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  35.58 
 
 		 699 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  37.57 
 
 		 679 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.58 
 
 		 671 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  37.5 
 
 		 688 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  37.5 
 
 		 688 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  37.5 
 
 		 688 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1055  membrane protein-like  36.41 
 
 		 773 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00532774  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2120  membrane protein, putative efflux pump  37.57 
 
 		 680 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0240  putative multidrug resistance protein MdtO  37.99 
 
 		 600 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  30.58 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  30.58 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  28.57 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  27.82 
 
 		 725 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  24.31 
 
 		 729 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.27 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  20.95 
 
 		 711 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  23.56 
 
 		 733 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  23.56 
 
 		 733 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  20 
 
 		 712 aa  45.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  20 
 
 		 712 aa  45.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  23.44 
 
 		 732 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  22.7 
 
 		 728 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.07 
 
 		 746 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  21.43 
 
 		 717 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  21.43 
 
 		 717 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  21.43 
 
 		 717 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  21.43 
 
 		 717 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  21.68 
 
 		 733 aa  44.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  21.43 
 
 		 717 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  19.52 
 
 		 712 aa  44.3  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  20.98 
 
 		 720 aa  43.9  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>