30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6555 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6555  multidrug efflux system protein MdtO  100 
 
 		 708 aa  1409    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4326  multidrug efflux system protein MdtO  35.66 
 
 		 683 aa  331  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4638  multidrug efflux system protein MdtO  35.66 
 
 		 683 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5589  multidrug efflux system protein MdtO  35.18 
 
 		 683 aa  327  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3911  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.34 
 
 		 683 aa  327  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3946  multidrug efflux system protein MdtO  35.18 
 
 		 683 aa  326  7e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03913  hypothetical protein  35.34 
 
 		 683 aa  326  9e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03953  predicted multidrug efflux system component  35.34 
 
 		 683 aa  326  9e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4545  multidrug efflux system protein MdtO  35.34 
 
 		 683 aa  324  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.45 
 
 		 633 aa  203  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  28.45 
 
 		 633 aa  203  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0194  fusaric acid resistance protein region  29.99 
 
 		 660 aa  181  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  28.49 
 
 		 688 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  28.49 
 
 		 688 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  28.49 
 
 		 688 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  29.35 
 
 		 663 aa  171  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  27.45 
 
 		 665 aa  165  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3974  fusaric acid resistance protein region  42.86 
 
 		 720 aa  151  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2120  membrane protein, putative efflux pump  36.75 
 
 		 680 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0240  putative multidrug resistance protein MdtO  36.15 
 
 		 600 aa  143  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  41.67 
 
 		 699 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1055  membrane protein-like  45.24 
 
 		 773 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00532774  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  42.78 
 
 		 679 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.81 
 
 		 671 aa  56.6  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.31 
 
 		 688 aa  47  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.82 
 
 		 653 aa  47.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  26.47 
 
 		 664 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  24.85 
 
 		 347 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  30.14 
 
 		 361 aa  44.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.41 
 
 		 719 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>