40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2120 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  56.24 
 
 		 671 aa  694    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2120  membrane protein, putative efflux pump  100 
 
 		 680 aa  1342    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3974  fusaric acid resistance protein region  49.4 
 
 		 720 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  50.16 
 
 		 665 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  51.56 
 
 		 679 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  50.16 
 
 		 699 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  45.92 
 
 		 688 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  45.92 
 
 		 688 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  45.92 
 
 		 688 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  47.51 
 
 		 663 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0194  fusaric acid resistance protein region  48 
 
 		 660 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0240  putative multidrug resistance protein MdtO  41.03 
 
 		 600 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  37.76 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  37.76 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1055  membrane protein-like  50.29 
 
 		 773 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00532774  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6555  multidrug efflux system protein MdtO  29.12 
 
 		 708 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5589  multidrug efflux system protein MdtO  32.89 
 
 		 683 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4326  multidrug efflux system protein MdtO  37.57 
 
 		 683 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4545  multidrug efflux system protein MdtO  37.57 
 
 		 683 aa  134  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3911  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.43 
 
 		 683 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4638  multidrug efflux system protein MdtO  37.43 
 
 		 683 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3946  multidrug efflux system protein MdtO  37.43 
 
 		 683 aa  133  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03913  hypothetical protein  37.43 
 
 		 683 aa  133  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03953  predicted multidrug efflux system component  37.43 
 
 		 683 aa  133  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  28.29 
 
 		 713 aa  58.9  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  30.43 
 
 		 687 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  29.59 
 
 		 698 aa  50.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.87 
 
 		 697 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  24.45 
 
 		 681 aa  48.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  32.3 
 
 		 659 aa  48.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  29.59 
 
 		 625 aa  48.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.37 
 
 		 670 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  25.99 
 
 		 395 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  29.35 
 
 		 697 aa  47.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4736  hypothetical protein  26.94 
 
 		 392 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378543  normal  0.971977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  25.21 
 
 		 702 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  25.57 
 
 		 360 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.08 
 
 		 680 aa  45.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  29.14 
 
 		 682 aa  45.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0235  hypothetical protein  33.62 
 
 		 376 aa  44.3  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>