269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2185 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 304 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  50.95 
 
 		 285 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  55.04 
 
 		 319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  50.84 
 
 		 296 aa  249  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  48.63 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  32.33 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  35.27 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 		 274 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  35.27 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  34.82 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  34.38 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  32.2 
 
 		 357 aa  105  8e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  30.97 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  29.67 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  30.38 
 
 		 359 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  31.56 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  32.06 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  30.96 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  32.78 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  30.96 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  33.66 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  34.58 
 
 		 273 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 274 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  30.16 
 
 		 336 aa  95.5  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  31.66 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  31.66 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  30.51 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  27.89 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 367 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  32.6 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  32.72 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  30.71 
 
 		 328 aa  92  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  31.63 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.12 
 
 		 346 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  31.98 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 243 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  35.9 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 		 348 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  32.85 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  32.49 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  31.36 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  33.14 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  29.26 
 
 		 359 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 334 aa  86.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  26 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.25 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  30.13 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  24.48 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  36.05 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  24.48 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  29.31 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  32.02 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 355 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  29.61 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  25.74 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  26.37 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.47 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  35.47 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.06 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.06 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  29.06 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  33.74 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  29.31 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  29.31 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  29.73 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  29.31 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>