More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1349 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1349  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 287 aa  560  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0532  UbiA prenyltransferase  43.69 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249862 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1827  protoheme IX farnesyltransferase, putative  42.75 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000128435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0253  UbiA prenyltransferase  42.72 
 
 		 271 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0223  protoheme IX farnesyl transferase, putative  40.36 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1537  UbiA prenyltransferase  35.29 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.626554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2530  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  38.95 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0046  UbiA prenyltransferase  37.85 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000129053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  35.6 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  34.09 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  34.09 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  33.64 
 
 		 312 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  30.53 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  29.68 
 
 		 295 aa  95.5  8e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  32.04 
 
 		 302 aa  95.5  8e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  33.64 
 
 		 353 aa  95.5  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  30.73 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  29.1 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  37.31 
 
 		 310 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0047  UbiA prenyltransferase  36.5 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  33.2 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  31.73 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  31.78 
 
 		 298 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  26.15 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  28.88 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  32.39 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  25.81 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  37.91 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  32.28 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  31.72 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  30.85 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  29.97 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  35.37 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  33.01 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  33.76 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  30.71 
 
 		 312 aa  89  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  34.12 
 
 		 298 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  35.33 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  29.82 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 321 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  29.96 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  29.96 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  28.36 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  33.5 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  36.42 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  36.42 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  31.28 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  36.42 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  29.47 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  31.95 
 
 		 328 aa  86.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  36 
 
 		 302 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  33.66 
 
 		 315 aa  85.9  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  33.11 
 
 		 295 aa  85.5  8e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  36.96 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  30 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  30 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  30 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  33.18 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1429  protoheme IX farnesyltransferase  31.21 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0844546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  30.05 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  31.31 
 
 		 534 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  31.48 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  34.25 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  29.66 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  31.11 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  31.34 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  32.72 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  33.02 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  34.08 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  31.58 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  35.84 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  32.97 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  33.7 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  31.98 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  31.33 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  32.66 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  32.05 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  32.46 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  32.46 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  37.16 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  33.15 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  28.12 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  30.77 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  28.12 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  31.86 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  35.06 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  34.18 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  29.41 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  29.41 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  29.41 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  29.41 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  29.41 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  33.53 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  29.41 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  29.41 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  33 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  33.71 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  35.57 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  35.57 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>