More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2586 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  100 
 
 
296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  59.46 
 
 
294 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  57.68 
 
 
295 aa  334  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  54.92 
 
 
295 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  54.24 
 
 
295 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  52.41 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  54.58 
 
 
297 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  55.78 
 
 
296 aa  298  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  53.9 
 
 
297 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  54.21 
 
 
297 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  50.85 
 
 
300 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 
300 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  53.22 
 
 
297 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  52.88 
 
 
297 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  49.49 
 
 
299 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  50.17 
 
 
297 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  49.15 
 
 
300 aa  288  6e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  49.5 
 
 
295 aa  288  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  50 
 
 
296 aa  286  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  49.14 
 
 
307 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  49.49 
 
 
299 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  48.31 
 
 
294 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  51.34 
 
 
286 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  49.49 
 
 
299 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  50.68 
 
 
301 aa  277  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  50.7 
 
 
306 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  47.8 
 
 
300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  47.42 
 
 
309 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  47.42 
 
 
309 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  46.86 
 
 
312 aa  270  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  46.62 
 
 
320 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  49.07 
 
 
316 aa  264  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  46.78 
 
 
297 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  48.15 
 
 
309 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  51.19 
 
 
296 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  47.7 
 
 
294 aa  259  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  47.12 
 
 
297 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  45.73 
 
 
299 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  48.63 
 
 
301 aa  258  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  47.3 
 
 
290 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  47.87 
 
 
315 aa  256  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  46.83 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  47.19 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  50.17 
 
 
296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  47.57 
 
 
306 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  48.28 
 
 
296 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  43.49 
 
 
290 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  42.81 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  45.61 
 
 
337 aa  239  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  44.6 
 
 
299 aa  239  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  49.65 
 
 
295 aa  238  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  45.42 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  46.32 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  44.12 
 
 
290 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  43.58 
 
 
293 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  43.58 
 
 
293 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  49.44 
 
 
295 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  45.59 
 
 
296 aa  228  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  45.59 
 
 
296 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  45.96 
 
 
296 aa  228  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  42.6 
 
 
334 aa  227  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  42.37 
 
 
292 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  46.9 
 
 
295 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  42.42 
 
 
294 aa  227  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  42.91 
 
 
294 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  46.9 
 
 
295 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  45.94 
 
 
297 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  45.93 
 
 
296 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  46.05 
 
 
298 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  42.71 
 
 
297 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  51.49 
 
 
297 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  46.42 
 
 
298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  45.59 
 
 
296 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  45.59 
 
 
296 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  45.59 
 
 
296 aa  225  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  45.59 
 
 
296 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  45.59 
 
 
296 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  44.19 
 
 
318 aa  225  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  42.57 
 
 
294 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  42.81 
 
 
293 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  48.97 
 
 
295 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  42.81 
 
 
293 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  42.57 
 
 
294 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  42.57 
 
 
294 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  47.74 
 
 
295 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  42.03 
 
 
294 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  42.57 
 
 
294 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  41.61 
 
 
335 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  47.39 
 
 
295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  48.07 
 
 
295 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  40.96 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  43.01 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  47.9 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  43.48 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  42.01 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  48.07 
 
 
295 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  41.53 
 
 
299 aa  219  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  44.44 
 
 
287 aa  218  7.999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  40.88 
 
 
296 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  41.55 
 
 
294 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>