201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2142 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 291 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  53.26 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  52.58 
 
 		 291 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  45.21 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  48.34 
 
 		 296 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  43.64 
 
 		 289 aa  259  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  41.78 
 
 		 292 aa  258  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  41.58 
 
 		 292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  45.39 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  44.18 
 
 		 293 aa  246  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  42.86 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  41.92 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  39.43 
 
 		 293 aa  228  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  43.36 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  42.41 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  43.07 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  43.8 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  38.83 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  42.03 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  39.52 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  39.86 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  42.7 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  40.61 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  40.55 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  40.27 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  39.18 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  39.37 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  39.66 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  38.57 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  39.18 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  38.01 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  39.8 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  37.97 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  37.97 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  34.17 
 
 		 380 aa  178  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  30.18 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  33.57 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  31.73 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  32.89 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 		 399 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  31.88 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  31.06 
 
 		 388 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  33.97 
 
 		 386 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  31.56 
 
 		 373 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.65 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  32.12 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  32.73 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  28.77 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  29.17 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.9 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  25.45 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  22.08 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  34.59 
 
 		 156 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.21 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 527 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.46 
 
 		 466 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 533 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20660  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  25.77 
 
 		 470 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 		 490 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4335  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.98 
 
 		 389 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.04 
 
 		 393 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.44 
 
 		 478 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3496  hypothetical protein  67.74 
 
 		 38 aa  52.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.871156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  25.86 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  28.08 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  24.06 
 
 		 459 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 518 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2062  putative methyltransferase, or Fe-S oxidoreductase  26.92 
 
 		 473 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6809  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0385  hypothetical protein  26.92 
 
 		 473 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 705 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 495 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 473 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  26.37 
 
 		 473 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 503 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 497 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2201  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.37 
 
 		 473 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.7 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1226  coproporphyrinogen dehydrogenase  26.79 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000226864  normal  0.222132 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 481 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 481 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 481 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 473 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4283  radical SAM family protein  28.41 
 
 		 480 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1053  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.41 
 
 		 473 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3408  radical SAM family protein  27.47 
 
 		 473 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1050  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 473 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0795903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 506 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4901  radical SAM family protein  26.92 
 
 		 474 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>