More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1318 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  50.72 
 
 
697 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.37 
 
 
693 aa  659    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.29 
 
 
708 aa  703    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.51 
 
 
691 aa  659    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.03 
 
 
693 aa  700    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
756 aa  1557    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.05 
 
 
695 aa  843    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.43 
 
 
691 aa  649    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.57 
 
 
698 aa  673    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.56 
 
 
699 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.83 
 
 
698 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.64 
 
 
698 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.89 
 
 
697 aa  615  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.04 
 
 
723 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.25 
 
 
698 aa  545  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.44 
 
 
691 aa  537  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.14 
 
 
706 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.63 
 
 
689 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.01 
 
 
713 aa  532  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.35 
 
 
718 aa  531  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.44 
 
 
734 aa  525  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  43.57 
 
 
691 aa  524  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.56 
 
 
704 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.11 
 
 
691 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.5 
 
 
712 aa  515  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 
691 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.26 
 
 
691 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.68 
 
 
754 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.08 
 
 
724 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.03 
 
 
745 aa  505  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.02 
 
 
733 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.43 
 
 
729 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.9 
 
 
714 aa  501  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.84 
 
 
749 aa  498  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.69 
 
 
788 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.73 
 
 
979 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.12 
 
 
766 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.93 
 
 
708 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.42 
 
 
756 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.81 
 
 
712 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.49 
 
 
762 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.71 
 
 
679 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.71 
 
 
706 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.09 
 
 
741 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.9 
 
 
706 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.6 
 
 
448 aa  278  3e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.73 
 
 
588 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.97 
 
 
602 aa  237  7e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.73 
 
 
606 aa  233  9e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.49 
 
 
543 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.49 
 
 
543 aa  227  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.49 
 
 
543 aa  227  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.3 
 
 
592 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.19 
 
 
590 aa  223  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.36 
 
 
593 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.36 
 
 
593 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.82 
 
 
646 aa  221  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.63 
 
 
705 aa  221  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.27 
 
 
634 aa  221  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.66 
 
 
1376 aa  220  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.67 
 
 
615 aa  220  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.88 
 
 
705 aa  220  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.88 
 
 
705 aa  220  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  37.88 
 
 
705 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  37.88 
 
 
705 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32 
 
 
706 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.28 
 
 
725 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.88 
 
 
705 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.65 
 
 
592 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.6 
 
 
705 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.1 
 
 
709 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.6 
 
 
705 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.42 
 
 
611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.42 
 
 
611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.47 
 
 
709 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.76 
 
 
731 aa  218  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.9 
 
 
623 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.87 
 
 
705 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.14 
 
 
618 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.96 
 
 
633 aa  215  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.84 
 
 
716 aa  215  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.87 
 
 
705 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.81 
 
 
630 aa  213  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.7 
 
 
625 aa  213  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.69 
 
 
607 aa  213  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.01 
 
 
592 aa  213  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.02 
 
 
711 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.02 
 
 
729 aa  213  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.99 
 
 
630 aa  212  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.57 
 
 
602 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.9 
 
 
622 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.92 
 
 
718 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.95 
 
 
617 aa  211  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.09 
 
 
563 aa  211  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.46 
 
 
451 aa  211  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  36.51 
 
 
679 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.87 
 
 
647 aa  211  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  38.42 
 
 
613 aa  211  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  36.52 
 
 
504 aa  210  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.31 
 
 
724 aa  210  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>