More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3287 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 288 aa  541  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  69.93 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  70.88 
 
 		 305 aa  360  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  70.28 
 
 		 293 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  70.28 
 
 		 293 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  61.25 
 
 		 306 aa  330  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  63.64 
 
 		 289 aa  323  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  36.26 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  38.6 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  31.77 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 340 aa  89  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  31.25 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 		 367 aa  85.5  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  30.43 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  29.82 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  30.97 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  30.67 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.96 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.78 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.73 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  25.09 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  30.66 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  31.11 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  31.56 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  29.35 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  28.52 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.52 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  29.47 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  27.65 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  32.16 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  24.49 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  24 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  24 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  24 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  24 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  24 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  24 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  28.28 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  24.09 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.71 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.91 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  30.28 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  25.27 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  29.09 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.49 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.91 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  23.49 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  21.13 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  26.79 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  27.74 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  28.95 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  30.11 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  29.37 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  24.83 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  29.88 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  22.22 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  23.53 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  32.06 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  30.32 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  31.07 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  21.13 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  21.18 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  20.77 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  28.72 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.99 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.35 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  21.53 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  26.09 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  24.83 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  21.53 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  31.02 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.22 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  26.19 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  28.27 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>