259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1231 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 318 aa  646    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  72.04 
 
 		 312 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  54.55 
 
 		 438 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  36.88 
 
 		 337 aa  189  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  35.21 
 
 		 367 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  35.92 
 
 		 382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  35.74 
 
 		 378 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  36.3 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  33.97 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  33.23 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  34.66 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  35.09 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  33.13 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  29.64 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.3 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.76 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  33 
 
 		 364 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.02 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  29.04 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  30.32 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  32.08 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  29.35 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.15 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  32.16 
 
 		 333 aa  95.9  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  30.15 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  30.15 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  28.68 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  27.54 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.9 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  27.19 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  22.54 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  26.14 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.44 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.39 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 		 339 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  26.3 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 		 349 aa  86.7  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  27.67 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  25.17 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  25.76 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  25.28 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  29.01 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  25.32 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  26.39 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  27 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.38 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.24 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  25.08 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  24.77 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  24.62 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  26.1 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>