More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1602 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  100 
 
 
242 aa  493  1e-138  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  67.92 
 
 
241 aa  349  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  71.31 
 
 
240 aa  345  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  68.62 
 
 
240 aa  337  1e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  66.95 
 
 
241 aa  330  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  62.55 
 
 
247 aa  304  1e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  58.51 
 
 
249 aa  292  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.57 
 
 
336 aa  283  2e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  55.65 
 
 
244 aa  281  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
277 aa  280  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  55.38 
 
 
251 aa  278  8e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  58.65 
 
 
246 aa  277  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.82009e-07 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  52.92 
 
 
241 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  57.69 
 
 
246 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.4361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  54.17 
 
 
250 aa  277  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  55.17 
 
 
244 aa  276  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  53.97 
 
 
244 aa  276  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  54.31 
 
 
244 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  56.72 
 
 
241 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  56.72 
 
 
241 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  55.65 
 
 
259 aa  276  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  55 
 
 
241 aa  275  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  52.89 
 
 
243 aa  275  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  54.17 
 
 
241 aa  273  1e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  57.26 
 
 
240 aa  274  1e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  54.39 
 
 
240 aa  273  1e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  53.16 
 
 
244 aa  273  1e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  54.58 
 
 
241 aa  273  2e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  53.47 
 
 
255 aa  273  2e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  54.29 
 
 
262 aa  273  2e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  56.52 
 
 
332 aa  273  2e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 
241 aa  273  2e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  54.29 
 
 
262 aa  273  2e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  57.33 
 
 
247 aa  273  2e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  56.52 
 
 
333 aa  273  2e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  56.52 
 
 
316 aa  273  2e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  54.51 
 
 
241 aa  273  2e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  53.59 
 
 
244 aa  272  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  53.44 
 
 
262 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  54.58 
 
 
241 aa  272  4e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  54.58 
 
 
241 aa  272  4e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  52.26 
 
 
243 aa  272  4e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  54.29 
 
 
264 aa  271  5e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  53.22 
 
 
247 aa  271  5e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 
262 aa  271  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  52.08 
 
 
244 aa  271  6e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 
258 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 
241 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 
258 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 
258 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 
258 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 
258 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  54.58 
 
 
241 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  53.66 
 
 
258 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 
258 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  54.47 
 
 
268 aa  271  8e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  53.53 
 
 
310 aa  271  8e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 
258 aa  271  8e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  55 
 
 
241 aa  271  8e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.81 
 
 
241 aa  271  9e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  53.75 
 
 
241 aa  271  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  54.13 
 
 
256 aa  270  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  55.42 
 
 
241 aa  270  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  54.29 
 
 
263 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  53.36 
 
 
243 aa  270  1e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.17 
 
 
241 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  53.47 
 
 
256 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  54.29 
 
 
265 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  55.65 
 
 
317 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  53.16 
 
 
239 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  53.66 
 
 
266 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  53.17 
 
 
258 aa  269  3e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  53.75 
 
 
241 aa  269  3e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  52.79 
 
 
243 aa  269  3e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  9.37515e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  53.17 
 
 
258 aa  269  3e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  53.17 
 
 
258 aa  269  3e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  57.38 
 
 
241 aa  268  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  53.25 
 
 
258 aa  268  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  55.93 
 
 
239 aa  268  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  56.54 
 
 
246 aa  269  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  53.78 
 
 
254 aa  268  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  53.11 
 
 
317 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  56.6 
 
 
261 aa  268  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  53.31 
 
 
255 aa  268  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  55.51 
 
 
247 aa  268  8e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 
246 aa  267  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  52.63 
 
 
258 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  55.7 
 
 
290 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  54.36 
 
 
268 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  55.22 
 
 
314 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  52.85 
 
 
258 aa  266  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  55.23 
 
 
240 aa  267  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  53.16 
 
 
267 aa  267  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  55.7 
 
 
289 aa  267  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  53.04 
 
 
256 aa  267  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  51.26 
 
 
239 aa  267  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  2.81481e-11 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  50.84 
 
 
246 aa  266  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  52.85 
 
 
258 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  50 
 
 
241 aa  266  3e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  55.27 
 
 
289 aa  265  3e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>