117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1517 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  83.54 
 
 		 164 aa  287  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  76.54 
 
 		 163 aa  266  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  57.5 
 
 		 164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  56.25 
 
 		 165 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  56.25 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  56.25 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  56.25 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  56.25 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  56.25 
 
 		 164 aa  178  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  56.25 
 
 		 164 aa  178  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  55.83 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  55.83 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  56.25 
 
 		 165 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  47.83 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  51.57 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  50.94 
 
 		 165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  50.93 
 
 		 165 aa  163  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  50.93 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  51.55 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  51.55 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  51.55 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  51.55 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  50.93 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  51.55 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  39.1 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  41.46 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  36.77 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  34.44 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  33.75 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  36.31 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  34.18 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  32.7 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  33.74 
 
 		 195 aa  91.7  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  29.56 
 
 		 166 aa  90.5  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  32.7 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  30.82 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  28.93 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  30.19 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  30.19 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  29.56 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  28.93 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  31.01 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  34.64 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  28.3 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  26.92 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  25.79 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  25.79 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  25.79 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  27.04 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  26.51 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  25.16 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  25.16 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  22.01 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  26.42 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  22.64 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 		 674 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  44.12 
 
 		 673 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  38.89 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  32.35 
 
 		 336 aa  51.2  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 204 aa  50.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  27.27 
 
 		 352 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 		 662 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  41.18 
 
 		 671 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  31.88 
 
 		 684 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 335 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  31.75 
 
 		 720 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 335 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 		 664 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 335 aa  47.8  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 		 564 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 		 636 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  40.91 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 667 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  36.71 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  34.38 
 
 		 332 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 206 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  42.31 
 
 		 232 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  31.65 
 
 		 231 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  29 
 
 		 697 aa  44.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  38.89 
 
 		 219 aa  44.3  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  29.58 
 
 		 764 aa  44.3  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  30.1 
 
 		 350 aa  44.3  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  26.19 
 
 		 233 aa  44.3  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 		 757 aa  44.3  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0117  TrkA domain-containing protein  43.75 
 
 		 214 aa  43.9  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  41.18 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  34.48 
 
 		 351 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  37.29 
 
 		 351 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  36.11 
 
 		 682 aa  43.9  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  36.07 
 
 		 346 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 		 672 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  37.5 
 
 		 652 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  30.56 
 
 		 567 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  28.99 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 771 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  26.25 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  33.85 
 
 		 542 aa  42.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 672 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  35.29 
 
 		 231 aa  41.6  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>