More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0477 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 184 aa  208  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  208  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  57.39 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  55.56 
 
 		 183 aa  204  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  54.7 
 
 		 184 aa  204  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  53.98 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  201  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  200  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  53.71 
 
 		 185 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  53.71 
 
 		 185 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  53.07 
 
 		 184 aa  197  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  52.84 
 
 		 184 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  54.39 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 187 aa  190  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  53.45 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 174 aa  188  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 181 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 182 aa  187  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  50 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  52 
 
 		 182 aa  185  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 190 aa  184  7e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 190 aa  184  7e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  47.51 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 187 aa  184  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  48.84 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  48.54 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  49.13 
 
 		 173 aa  181  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  48 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 182 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  48.57 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>