More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0028 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
220 aa  451  1e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  46.89 
 
 
214 aa  207  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  40.64 
 
 
251 aa  173  2e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  46.45 
 
 
207 aa  173  2e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  45.75 
 
 
211 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  43.4 
 
 
209 aa  170  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  43.6 
 
 
208 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  39.34 
 
 
209 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  41.04 
 
 
209 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 
210 aa  157  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  42.71 
 
 
213 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  40.57 
 
 
209 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  36.19 
 
 
202 aa  152  3e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  41.47 
 
 
210 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  38.57 
 
 
207 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.86838e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
213 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  40.95 
 
 
205 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  5.49236e-08 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 
207 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  39.52 
 
 
205 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  40.67 
 
 
213 aa  145  4e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 
207 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  40.85 
 
 
218 aa  144  8e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 
206 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  39.91 
 
 
218 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  39.81 
 
 
217 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  39.44 
 
 
215 aa  141  9e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
217 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 
226 aa  140  1e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
213 aa  140  1e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  36.49 
 
 
237 aa  140  2e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  41.58 
 
 
205 aa  140  2e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  38.28 
 
 
213 aa  139  5e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  38.68 
 
 
205 aa  138  5e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  37.26 
 
 
214 aa  137  9e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  40.85 
 
 
218 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  37.14 
 
 
218 aa  136  3e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  38.28 
 
 
213 aa  135  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  40.67 
 
 
232 aa  134  1e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  37.56 
 
 
258 aa  134  1e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.27 
 
 
235 aa  132  4e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  38.21 
 
 
217 aa  132  4e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  38.65 
 
 
222 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 
212 aa  131  7e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 
229 aa  130  1e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  34.78 
 
 
229 aa  130  1e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 
226 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 
212 aa  129  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 
215 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
213 aa  128  7e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  37.5 
 
 
222 aa  127  1e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  38.53 
 
 
209 aa  127  1e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 
212 aa  127  1e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.26138e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  39.9 
 
 
213 aa  127  2e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  38.21 
 
 
215 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
214 aa  125  4e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
214 aa  125  4e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  35.98 
 
 
207 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  36.62 
 
 
249 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 
215 aa  124  8e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 
220 aa  124  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
214 aa  124  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  38.16 
 
 
216 aa  124  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  35.48 
 
 
213 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
214 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.6 
 
 
233 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 
214 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 
214 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 
213 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 
238 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.61 
 
 
229 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  36.15 
 
 
249 aa  122  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  36.02 
 
 
215 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
206 aa  120  1e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  36.54 
 
 
214 aa  120  1e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 
216 aa  121  1e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.76 
 
 
209 aa  120  2e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  35.12 
 
 
214 aa  120  2e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
209 aa  120  2e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 
210 aa  120  2e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.22516e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  36.1 
 
 
214 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  36.06 
 
 
195 aa  120  2e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  37.39 
 
 
231 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  39.3 
 
 
213 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.92 
 
 
201 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
206 aa  119  4e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.05 
 
 
243 aa  119  4e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  35.81 
 
 
237 aa  119  5e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  37.78 
 
 
238 aa  118  8e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 
208 aa  118  8e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  36.45 
 
 
214 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 
212 aa  117  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.35 
 
 
215 aa  117  1e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
238 aa  117  1e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  1.81534e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  35.78 
 
 
215 aa  117  2e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.49 
 
 
239 aa  117  2e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  3.96762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  38.74 
 
 
231 aa  116  2e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  34.88 
 
 
215 aa  117  2e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
238 aa  116  2e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
219 aa  117  2e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  37.91 
 
 
214 aa  117  2e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>