More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4526 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
307 aa  635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
323 aa  96.3  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
324 aa  89.7  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
310 aa  89.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  27.73 
 
 
328 aa  89  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 
325 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 
323 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  26.93 
 
 
331 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  25.46 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 
862 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 
324 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  27.54 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  29.33 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  29.15 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  29.15 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  29.15 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  28.4 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  29.15 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  29.15 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  29.15 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.27 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.12 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.23 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  24.28 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  26.97 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  25.83 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  26 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  25.72 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  27.09 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0383  beta-lactamase domain protein  27 
 
 
213 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 
246 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  27.04 
 
 
213 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4168  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  23.6 
 
 
357 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  26.03 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.97 
 
 
357 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  25.11 
 
 
211 aa  62.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 
356 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.25 
 
 
334 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.07 
 
 
278 aa  62.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.31 
 
 
214 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 
320 aa  62.4  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 
354 aa  62.4  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  23.95 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 
317 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  28.63 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
243 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  23.55 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  26.87 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 
210 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  23.53 
 
 
354 aa  60.1  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  23.64 
 
 
348 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  25.58 
 
 
309 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  22.73 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  24.22 
 
 
359 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  24.36 
 
 
359 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  24.36 
 
 
359 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  25.57 
 
 
354 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 
369 aa  59.7  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  23.72 
 
 
358 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6360  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 
389 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0683384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>