36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6360 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6360  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
389 aa  786    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0683384  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 
307 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 
307 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  30.64 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  28.51 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  27.14 
 
 
331 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
361 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  28.16 
 
 
326 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  28.16 
 
 
323 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 
310 aa  46.6  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 
266 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 
264 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 
324 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0395  hypothetical protein  22.18 
 
 
515 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 
267 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 
323 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  27.22 
 
 
285 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  37.11 
 
 
340 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  27.59 
 
 
326 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 
323 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 
323 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 
302 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
301 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 
323 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  24.61 
 
 
310 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 
333 aa  43.1  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 
306 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.11 
 
 
348 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  26.02 
 
 
354 aa  42.7  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>