More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0054 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0054  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 305 aa  628  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510495  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 391 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 364 aa  99.4  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 364 aa  99  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 364 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  26.8 
 
 		 368 aa  96.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 		 360 aa  93.2  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 1080 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 393 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 		 403 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  31.46 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 401 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 367 aa  86.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 413 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  25.49 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.29 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  21.89 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  22.48 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.46 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.37 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  23.53 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.93 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  22.48 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  22.78 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.53 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  21.86 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  24.44 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.32 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  23.19 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0440  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.438778  normal  0.0102055 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 370 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 443 aa  72.4  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  23.67 
 
 		 398 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>