274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0995 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  50.95 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  55.75 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  42.7 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  47.06 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  46.61 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  35.41 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  33.94 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  33.49 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  34.51 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  30.24 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  32.51 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  34.31 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  34.57 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  33.89 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  33.47 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  30.74 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  33.02 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  31.71 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  32.66 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  35.18 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  32.09 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  32.47 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 		 359 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  34.88 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  35.29 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  33.64 
 
 		 355 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  33.18 
 
 		 358 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  33.18 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  33.18 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.22 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 		 348 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  32.6 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  33.54 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  32.6 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 		 296 aa  92.4  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 356 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 356 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  27.63 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  30.49 
 
 		 356 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  32.04 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  30.39 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 		 329 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  30.28 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 		 334 aa  89.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  32.56 
 
 		 346 aa  89  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  30.91 
 
 		 348 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  30.1 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 		 414 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  33.13 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  28.38 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  29.66 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  28.91 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  29.66 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  37.01 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  37.68 
 
 		 357 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  37.68 
 
 		 357 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  37.68 
 
 		 357 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  37.68 
 
 		 357 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  37.68 
 
 		 357 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  37.68 
 
 		 357 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  37.68 
 
 		 357 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 		 332 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 		 330 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  29.26 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  29.57 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  28.15 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  28.35 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  30.29 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  32.34 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>