More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3194 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  69.75 
 
 		 465 aa  649    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  100 
 
 		 480 aa  970    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  58 
 
 		 456 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.74 
 
 		 442 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  56.28 
 
 		 449 aa  511  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  55.86 
 
 		 449 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.86 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.73 
 
 		 455 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 445 aa  259  7e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  45.64 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 459 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  44.85 
 
 		 412 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 421 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 420 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 429 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  42.14 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  36.41 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  40.33 
 
 		 429 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  39.03 
 
 		 453 aa  204  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 433 aa  197  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  30.69 
 
 		 472 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  30.04 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  30.12 
 
 		 455 aa  194  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.88 
 
 		 365 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  36.74 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  37.2 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  36.51 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 449 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  31.77 
 
 		 465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  37.55 
 
 		 449 aa  183  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  38.14 
 
 		 458 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  35.41 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 362 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0747597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  31.74 
 
 		 446 aa  173  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 446 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  34.7 
 
 		 457 aa  170  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 435 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.23 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  34.12 
 
 		 461 aa  167  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  36.65 
 
 		 449 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  35.94 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  36.26 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 570 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  33.55 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 445 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  35.22 
 
 		 446 aa  159  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  35.53 
 
 		 445 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  35.07 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  37.17 
 
 		 446 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  34.43 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  37.59 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  34.91 
 
 		 462 aa  150  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  36.96 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  37.23 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  35.82 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  37.23 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 471 aa  146  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  37.45 
 
 		 456 aa  146  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  34.07 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 554 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00056793  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  32.52 
 
 		 471 aa  144  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  35.14 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  35.14 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  35.14 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  35.14 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  35.14 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  35.14 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 563 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  35.14 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  35.14 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>