84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0622 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  100 
 
 		 430 aa  852    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  59.29 
 
 		 403 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  58.59 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  57.41 
 
 		 409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  47 
 
 		 410 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  27.84 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  27.76 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  31.43 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  31.58 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  31.5 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  28.98 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  32.18 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  29.76 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  29.63 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  27.37 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  27.37 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  29.76 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  29.76 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  29.76 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  27.59 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  27.57 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  29.32 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  27.65 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  25.81 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  27.43 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  28.89 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  25.27 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  26.67 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  26.15 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  26.32 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  31.87 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  27.75 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  27.88 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  29.71 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  27.84 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  24.34 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  24.08 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  23.96 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  26.15 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  28.35 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  24.42 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  28.3 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  25.91 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  32.18 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  31.12 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  26.22 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  26.47 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  29.07 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  27.81 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  25 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  29.82 
 
 		 463 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  25.15 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  26.97 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  28.17 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  30.95 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  23.64 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  23.64 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  26.29 
 
 		 404 aa  53.9  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  25 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  29.23 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  27.03 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  23.45 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  23.68 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  25.9 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  26.88 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  24.86 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  23.16 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  23.21 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  25.85 
 
 		 389 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  28.21 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  30.28 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  27.61 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  27.69 
 
 		 487 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  25.13 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  26.86 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  29.38 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  28.67 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  25.99 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  24.44 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  21.83 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  24.71 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  25.53 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>