More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0391 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 		 457 aa  931    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  64.43 
 
 		 460 aa  599  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  63.74 
 
 		 455 aa  597  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  60.13 
 
 		 460 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  59.16 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  59.16 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  60.31 
 
 		 455 aa  541  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  55.58 
 
 		 485 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  43.85 
 
 		 469 aa  363  2e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  43.08 
 
 		 465 aa  358  9e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  38.62 
 
 		 458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  37.72 
 
 		 458 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  37.72 
 
 		 458 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  40.22 
 
 		 457 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  37.72 
 
 		 458 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  37.5 
 
 		 458 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  37.8 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  37.5 
 
 		 454 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  37.22 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 458 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 458 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  37.28 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  41.69 
 
 		 465 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  39.73 
 
 		 453 aa  345  7e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  37.05 
 
 		 458 aa  345  8e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  40.35 
 
 		 457 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  37.5 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  39.69 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  37.44 
 
 		 453 aa  332  8e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  37.36 
 
 		 458 aa  329  7e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  37.05 
 
 		 459 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  37.05 
 
 		 459 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  36.83 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  37 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  37 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  36.55 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  36.89 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  36.55 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  36.55 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  35.1 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  35.1 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  41.38 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  37.89 
 
 		 454 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  36.89 
 
 		 460 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  34.38 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  35.27 
 
 		 456 aa  302  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  34.6 
 
 		 451 aa  300  3e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  34.16 
 
 		 455 aa  299  8e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.16 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  36.04 
 
 		 458 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  34.83 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  34.79 
 
 		 471 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  34.47 
 
 		 459 aa  288  9e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  37.75 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  38.44 
 
 		 436 aa  285  9e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  35.07 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  34.84 
 
 		 451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  36.75 
 
 		 457 aa  279  9e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  36.61 
 
 		 468 aa  279  9e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  34.97 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.51 
 
 		 450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  33.93 
 
 		 493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  35.48 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.76 
 
 		 477 aa  271  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  33.76 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  33.62 
 
 		 480 aa  269  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.3 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  37.24 
 
 		 473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  32.09 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  33.76 
 
 		 478 aa  265  8.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.82 
 
 		 456 aa  264  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.44 
 
 		 496 aa  261  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.44 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  33.26 
 
 		 572 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  35.04 
 
 		 479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  33.11 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  31.32 
 
 		 488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  31.47 
 
 		 479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  31.07 
 
 		 471 aa  253  7e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  37.14 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  32.36 
 
 		 447 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  30.53 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  31.28 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  32.46 
 
 		 470 aa  249  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  31.63 
 
 		 470 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  32.84 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  29.57 
 
 		 470 aa  247  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  32.67 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  34.15 
 
 		 495 aa  246  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  29.58 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  31.1 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  34.02 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  33.51 
 
 		 554 aa  242  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  31.51 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  32.25 
 
 		 465 aa  240  4e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.57 
 
 		 513 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  32.73 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  30.34 
 
 		 488 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>