More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0853 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  100 
 
 
561 aa  1131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  50.81 
 
 
564 aa  572  1e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  46.46 
 
 
558 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  42.11 
 
 
573 aa  477  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  42.98 
 
 
570 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  6.26903e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  40.85 
 
 
787 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  42.07 
 
 
562 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  41.86 
 
 
563 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  40.18 
 
 
558 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  40.93 
 
 
553 aa  445  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.32 
 
 
553 aa  438  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  40.18 
 
 
553 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.46 
 
 
871 aa  435  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.88 
 
 
571 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.57 
 
 
553 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  40.46 
 
 
555 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  39.71 
 
 
554 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  38.26 
 
 
568 aa  417  1e-115  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  38.61 
 
 
561 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  39.07 
 
 
561 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  39.39 
 
 
564 aa  406  1e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  39.72 
 
 
561 aa  406  1e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.72 
 
 
561 aa  406  1e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  36.74 
 
 
567 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.31 
 
 
568 aa  399  1e-110  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  37.39 
 
 
570 aa  400  1e-110  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  38.53 
 
 
559 aa  400  1e-110  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  38.1 
 
 
571 aa  400  1e-110  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.3 
 
 
568 aa  402  1e-110  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.31 
 
 
568 aa  399  1e-110  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.63 
 
 
556 aa  399  1e-110  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  37.83 
 
 
557 aa  400  1e-110  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.93 
 
 
568 aa  400  1e-110  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.26 
 
 
568 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  38.31 
 
 
568 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.75 
 
 
568 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37.03 
 
 
557 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  35.69 
 
 
558 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  36.56 
 
 
589 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.85 
 
 
568 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  37.52 
 
 
568 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.67 
 
 
568 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  34.22 
 
 
577 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.52 
 
 
568 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  35.15 
 
 
568 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  36.69 
 
 
566 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  37.72 
 
 
599 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  37.76 
 
 
599 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  37.76 
 
 
599 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  37.81 
 
 
591 aa  378  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  35.69 
 
 
573 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  38.02 
 
 
885 aa  378  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.95 
 
 
563 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  36.1 
 
 
563 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  37.37 
 
 
603 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  36.19 
 
 
569 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  35.94 
 
 
568 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  34.96 
 
 
565 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  35.29 
 
 
574 aa  372  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  36.02 
 
 
891 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  34.22 
 
 
565 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  35.61 
 
 
612 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  37.31 
 
 
637 aa  369  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  35.66 
 
 
574 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  38.08 
 
 
520 aa  369  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.07 
 
 
571 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  33.45 
 
 
570 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  34.95 
 
 
561 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  35.29 
 
 
577 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  34.7 
 
 
572 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  37.5 
 
 
520 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  38.07 
 
 
888 aa  365  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  35.1 
 
 
688 aa  364  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  36.41 
 
 
587 aa  364  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  36.71 
 
 
576 aa  363  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  34.57 
 
 
574 aa  362  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  38.04 
 
 
554 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  36.47 
 
 
573 aa  361  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.30393e-05 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  36.92 
 
 
586 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  35.06 
 
 
570 aa  358  1e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  35.64 
 
 
582 aa  358  2e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  37.07 
 
 
520 aa  357  2e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.11826e-14 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  35.95 
 
 
573 aa  358  2e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  36.9 
 
 
520 aa  357  3e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  34.54 
 
 
577 aa  357  4e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  33.63 
 
 
587 aa  356  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  34.56 
 
 
586 aa  356  6e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  33.69 
 
 
584 aa  356  8e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  34.85 
 
 
577 aa  356  8e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  36.48 
 
 
823 aa  355  9e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  34.67 
 
 
586 aa  355  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  33.51 
 
 
586 aa  354  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  35.97 
 
 
571 aa  354  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  34.44 
 
 
573 aa  355  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  34.08 
 
 
586 aa  353  3e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  34.68 
 
 
594 aa  353  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  34.39 
 
 
586 aa  353  6e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  34.39 
 
 
586 aa  353  6e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  35.15 
 
 
575 aa  352  8e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  34.22 
 
 
586 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>