211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4051 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
443 aa  919    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  49.09 
 
 
436 aa  428  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.14 
 
 
432 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  46.49 
 
 
433 aa  411  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  47.14 
 
 
430 aa  404  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.12 
 
 
433 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.82 
 
 
444 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  44.19 
 
 
442 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  40.41 
 
 
440 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  41.86 
 
 
444 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  42.19 
 
 
452 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  40.36 
 
 
468 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  40.59 
 
 
432 aa  338  8e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  38.78 
 
 
472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  38.57 
 
 
457 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  38.57 
 
 
457 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 
437 aa  330  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  42.15 
 
 
438 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  42 
 
 
438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  40.71 
 
 
438 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.89 
 
 
440 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  38.88 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  40.9 
 
 
438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.29 
 
 
433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  39.62 
 
 
432 aa  305  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.36 
 
 
454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  36.85 
 
 
452 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  37.05 
 
 
481 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.19 
 
 
435 aa  297  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  37.16 
 
 
462 aa  296  7e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  38.1 
 
 
432 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.83 
 
 
447 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.89 
 
 
453 aa  292  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  33.86 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.46 
 
 
433 aa  286  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.24 
 
 
437 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  35.51 
 
 
455 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  34.96 
 
 
456 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.96 
 
 
456 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.96 
 
 
456 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  39.65 
 
 
436 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.73 
 
 
472 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  37.53 
 
 
444 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.73 
 
 
463 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  35.87 
 
 
461 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  33.41 
 
 
474 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  34.62 
 
 
425 aa  262  1e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  32.18 
 
 
476 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.94 
 
 
441 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  33.58 
 
 
431 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  33.08 
 
 
431 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.94 
 
 
445 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  30.28 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  32.46 
 
 
475 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  21.73 
 
 
481 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 
456 aa  60.1  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  29.45 
 
 
491 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  21.05 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  26.09 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  33.05 
 
 
478 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  33.05 
 
 
471 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  21.56 
 
 
448 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  32.2 
 
 
471 aa  56.6  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  29.52 
 
 
478 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  22.71 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  32.2 
 
 
478 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  23.28 
 
 
473 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  30 
 
 
468 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  32.2 
 
 
478 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  23.4 
 
 
425 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  20.73 
 
 
432 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.71 
 
 
459 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  29.33 
 
 
478 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  18.54 
 
 
446 aa  53.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  20 
 
 
495 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  32.2 
 
 
478 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  23.57 
 
 
578 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  25.71 
 
 
460 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 
483 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  25.56 
 
 
459 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.56 
 
 
459 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.56 
 
 
459 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  26.14 
 
 
466 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.92 
 
 
463 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  22.16 
 
 
468 aa  50.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  22.77 
 
 
473 aa  50.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  18.06 
 
 
418 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  27.61 
 
 
574 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.26 
 
 
473 aa  50.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
460 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  22.54 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.3 
 
 
462 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  21.55 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  24.14 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.56 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  21.91 
 
 
438 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.14 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  25 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  25 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>