More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3102 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 312 aa  654    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  36.81 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 		 315 aa  203  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  34.74 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.47 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  33.77 
 
 		 332 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  30.93 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  30.14 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.22 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.62 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.27 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  30.9 
 
 		 334 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  30.38 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.52 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 234 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  28.77 
 
 		 237 aa  96.7  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 338 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 		 242 aa  90.1  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.95 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 313 aa  89.4  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  26.2 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 1171 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  24.27 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.99 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  25.79 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 581 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.63 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  22.45 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 847 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 746 aa  69.3  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  24 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  34.55 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.4 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.43 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.29 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.82 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1625  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.82 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  31.3 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  24.44 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.82 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.91 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  23.47 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.27 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>