More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0498 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0498  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 910 aa  1882    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000157387  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0497  glycosyl transferase family protein  90.74 
 
 		 907 aa  1677    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  29.72 
 
 		 841 aa  290  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1213  glycosyl transferase family 51  29.07 
 
 		 985 aa  285  4.0000000000000003e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  28.73 
 
 		 827 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  27.71 
 
 		 793 aa  259  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2124  glycosyl transferase family 51  27.06 
 
 		 934 aa  258  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.563834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  27.85 
 
 		 830 aa  258  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  27.97 
 
 		 795 aa  257  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  35.46 
 
 		 824 aa  257  8e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  29.73 
 
 		 804 aa  255  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  27.59 
 
 		 777 aa  254  5.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  26.73 
 
 		 802 aa  253  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  37.82 
 
 		 861 aa  250  9e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  27.71 
 
 		 829 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  26.8 
 
 		 817 aa  244  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  26.8 
 
 		 817 aa  244  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  26.62 
 
 		 817 aa  244  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  27.07 
 
 		 865 aa  243  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0757  penicillin-binding protein  28.59 
 
 		 932 aa  241  2.9999999999999997e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  27.22 
 
 		 814 aa  241  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  26.54 
 
 		 817 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  27.91 
 
 		 792 aa  241  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  28.98 
 
 		 791 aa  241  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  27.29 
 
 		 823 aa  241  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  29.24 
 
 		 791 aa  241  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  28.35 
 
 		 774 aa  240  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  39.78 
 
 		 814 aa  239  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  30.04 
 
 		 796 aa  239  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  27.99 
 
 		 835 aa  239  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  26.83 
 
 		 803 aa  239  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  27.16 
 
 		 762 aa  238  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  26.82 
 
 		 823 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  29.23 
 
 		 800 aa  238  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  26.64 
 
 		 846 aa  237  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  27.15 
 
 		 823 aa  237  8e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  26.16 
 
 		 849 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0189  penicillin-binding protein, 1A family  27.12 
 
 		 799 aa  236  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  28.37 
 
 		 844 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.17 
 
 		 817 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0712  glycosyl transferase family 51  27.92 
 
 		 916 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  28.24 
 
 		 844 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1741  penicillin-binding protein  29.54 
 
 		 846 aa  235  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.213477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  28.11 
 
 		 844 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  26.09 
 
 		 807 aa  234  5e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  34.46 
 
 		 829 aa  232  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  27.22 
 
 		 804 aa  233  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  26.24 
 
 		 819 aa  233  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  26.96 
 
 		 755 aa  231  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  26.45 
 
 		 819 aa  231  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  28.61 
 
 		 790 aa  231  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  26.19 
 
 		 843 aa  230  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  27.25 
 
 		 855 aa  230  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  26.61 
 
 		 814 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  28.37 
 
 		 833 aa  230  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  26.77 
 
 		 809 aa  229  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  27.65 
 
 		 839 aa  229  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0833  penicillin-binding protein, 1A family  30.04 
 
 		 807 aa  229  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  26.81 
 
 		 839 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  26.83 
 
 		 814 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  27.17 
 
 		 760 aa  228  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  27.33 
 
 		 778 aa  228  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  27.64 
 
 		 803 aa  228  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  27.67 
 
 		 819 aa  226  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  26.53 
 
 		 831 aa  226  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  27.33 
 
 		 839 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  27.69 
 
 		 730 aa  226  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  28.11 
 
 		 822 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  26.09 
 
 		 839 aa  226  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  28.72 
 
 		 750 aa  225  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  35.88 
 
 		 727 aa  225  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  27.87 
 
 		 748 aa  225  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  27.32 
 
 		 819 aa  224  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  27.56 
 
 		 918 aa  224  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  27.41 
 
 		 839 aa  224  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  26.08 
 
 		 793 aa  224  7e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  26.61 
 
 		 793 aa  224  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  25.71 
 
 		 814 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  28.09 
 
 		 849 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  32.9 
 
 		 795 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  26.42 
 
 		 774 aa  223  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  27.25 
 
 		 851 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  28.38 
 
 		 778 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  27.25 
 
 		 851 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  27.25 
 
 		 851 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  32.41 
 
 		 765 aa  223  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  26.53 
 
 		 862 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  26.13 
 
 		 773 aa  222  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  26.86 
 
 		 797 aa  221  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  26.87 
 
 		 847 aa  221  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  28.28 
 
 		 783 aa  221  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  27.25 
 
 		 858 aa  221  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  27.91 
 
 		 790 aa  220  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  28.37 
 
 		 838 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  27.38 
 
 		 777 aa  220  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  27.35 
 
 		 805 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  26.34 
 
 		 752 aa  220  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  27.77 
 
 		 778 aa  219  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  29.52 
 
 		 852 aa  219  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  26.09 
 
 		 794 aa  219  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>