More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1741 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1741  penicillin-binding protein  100 
 
 		 846 aa  1747    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.213477  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0757  penicillin-binding protein  39.25 
 
 		 932 aa  567  1e-160  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0189  penicillin-binding protein, 1A family  32.02 
 
 		 799 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  29.94 
 
 		 804 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  31.3 
 
 		 795 aa  303  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  30.69 
 
 		 797 aa  297  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  29.29 
 
 		 841 aa  292  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  29.66 
 
 		 796 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  28.68 
 
 		 802 aa  289  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  29.68 
 
 		 827 aa  279  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  29.31 
 
 		 818 aa  277  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  29.5 
 
 		 818 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  29.49 
 
 		 829 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  28.98 
 
 		 773 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 		 793 aa  270  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  29.12 
 
 		 778 aa  270  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  29.35 
 
 		 807 aa  266  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  29.88 
 
 		 755 aa  265  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  28.06 
 
 		 748 aa  263  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  30.17 
 
 		 796 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  29.53 
 
 		 779 aa  261  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  29.47 
 
 		 774 aa  261  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  30.13 
 
 		 797 aa  260  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  29.4 
 
 		 792 aa  260  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  29.4 
 
 		 794 aa  260  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  30.45 
 
 		 797 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  30.45 
 
 		 797 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  28.65 
 
 		 797 aa  258  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  29.39 
 
 		 796 aa  258  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  27.68 
 
 		 796 aa  257  6e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  29.89 
 
 		 778 aa  256  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  30.16 
 
 		 795 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  30.13 
 
 		 797 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  29.71 
 
 		 774 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  29.49 
 
 		 762 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  26.1 
 
 		 852 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  29.77 
 
 		 730 aa  254  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  29.15 
 
 		 838 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  29.47 
 
 		 799 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 797 aa  254  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  28.24 
 
 		 760 aa  253  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  29.47 
 
 		 799 aa  253  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  28.8 
 
 		 766 aa  252  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  28.64 
 
 		 814 aa  252  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  28.3 
 
 		 777 aa  252  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  27.99 
 
 		 852 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  28.81 
 
 		 791 aa  251  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  28.67 
 
 		 743 aa  250  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  29.48 
 
 		 750 aa  249  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  28.81 
 
 		 862 aa  249  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  30.31 
 
 		 791 aa  249  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  28.23 
 
 		 852 aa  249  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  25.85 
 
 		 819 aa  248  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  27.99 
 
 		 852 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  28.67 
 
 		 797 aa  248  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  29.55 
 
 		 802 aa  247  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 803 aa  247  6.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  28.59 
 
 		 835 aa  247  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  28.99 
 
 		 794 aa  246  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  28.65 
 
 		 804 aa  246  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  28.71 
 
 		 793 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  28.35 
 
 		 830 aa  245  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  25.61 
 
 		 819 aa  244  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  27.98 
 
 		 752 aa  244  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  25.61 
 
 		 819 aa  244  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  28.46 
 
 		 771 aa  244  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  28.12 
 
 		 840 aa  244  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  29.02 
 
 		 794 aa  244  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  28.24 
 
 		 824 aa  242  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  28.24 
 
 		 839 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  29.27 
 
 		 791 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  29.86 
 
 		 778 aa  242  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2085  penicillin-binding protein, 1A family  28.09 
 
 		 904 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535891  normal  0.507146 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  28.17 
 
 		 839 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  27.89 
 
 		 803 aa  241  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  28.17 
 
 		 839 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  28.26 
 
 		 839 aa  241  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  26.32 
 
 		 809 aa  241  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  28.26 
 
 		 790 aa  240  8e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  28.04 
 
 		 839 aa  240  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  27.96 
 
 		 846 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  30.01 
 
 		 797 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  28.24 
 
 		 814 aa  240  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  27.73 
 
 		 840 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  27.73 
 
 		 840 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  27.73 
 
 		 840 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  30.01 
 
 		 797 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  30.01 
 
 		 797 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  30.01 
 
 		 797 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1752  1A family penicillin-binding protein  30.01 
 
 		 770 aa  239  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  27.26 
 
 		 851 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  27.26 
 
 		 851 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  28.37 
 
 		 800 aa  239  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  27.26 
 
 		 851 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  28.82 
 
 		 814 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  30.01 
 
 		 797 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  28.29 
 
 		 833 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  28.81 
 
 		 817 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  28.81 
 
 		 817 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  27.28 
 
 		 835 aa  238  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>