128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0226 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0226  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1217    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000930043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3852  hypothetical protein  26.38 
 
 		 586 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  23.12 
 
 		 613 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  20.89 
 
 		 617 aa  91.3  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  21.63 
 
 		 618 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  22.81 
 
 		 627 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  21.36 
 
 		 607 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  21.3 
 
 		 614 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  20.73 
 
 		 614 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  21.59 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  21.59 
 
 		 614 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  21.76 
 
 		 614 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  21.16 
 
 		 607 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  21.16 
 
 		 607 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  21.28 
 
 		 629 aa  78.2  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  21.24 
 
 		 617 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  19.9 
 
 		 613 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  21.03 
 
 		 624 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  24.44 
 
 		 602 aa  74.3  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  22.15 
 
 		 605 aa  73.9  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  19.51 
 
 		 625 aa  72  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  21.96 
 
 		 617 aa  71.2  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  21.2 
 
 		 618 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  21.11 
 
 		 615 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  20.98 
 
 		 587 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  20.93 
 
 		 615 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  20.33 
 
 		 616 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  20.52 
 
 		 616 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  21.03 
 
 		 622 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  20.33 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  22.48 
 
 		 628 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  20.74 
 
 		 615 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  20.33 
 
 		 616 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  22.1 
 
 		 613 aa  66.6  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  20.58 
 
 		 615 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  21.43 
 
 		 636 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  19.24 
 
 		 610 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  20.19 
 
 		 594 aa  65.1  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  22.67 
 
 		 589 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  18.65 
 
 		 605 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  28.31 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  21.6 
 
 		 611 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  20.41 
 
 		 628 aa  62.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  21.49 
 
 		 565 aa  62.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  21.32 
 
 		 633 aa  61.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  20.85 
 
 		 625 aa  61.2  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  20.45 
 
 		 608 aa  60.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  21.02 
 
 		 1283 aa  60.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  23.4 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  19.05 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  22.59 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  21.51 
 
 		 609 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  21.05 
 
 		 609 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  21.51 
 
 		 609 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  21.05 
 
 		 609 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  21.28 
 
 		 611 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  20.43 
 
 		 609 aa  55.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  20.11 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  19.67 
 
 		 599 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  20.07 
 
 		 595 aa  54.7  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  23.32 
 
 		 549 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  21.28 
 
 		 609 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  20.08 
 
 		 583 aa  54.7  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  23.32 
 
 		 549 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  23.32 
 
 		 549 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  19.52 
 
 		 621 aa  54.7  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  20.89 
 
 		 599 aa  54.3  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  23.18 
 
 		 604 aa  54.3  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  20.83 
 
 		 609 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  22.12 
 
 		 611 aa  53.9  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  19.9 
 
 		 616 aa  53.9  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  20.33 
 
 		 629 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  19.27 
 
 		 591 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  21.03 
 
 		 592 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  26.7 
 
 		 547 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  20.68 
 
 		 639 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  20.74 
 
 		 609 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  19.44 
 
 		 637 aa  52.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  18.73 
 
 		 635 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  20.47 
 
 		 607 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  20.83 
 
 		 599 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  20.42 
 
 		 609 aa  51.6  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  26.03 
 
 		 588 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  20.05 
 
 		 646 aa  51.6  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  19.53 
 
 		 582 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  18.56 
 
 		 608 aa  51.6  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  20.05 
 
 		 619 aa  51.2  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  20.31 
 
 		 609 aa  51.2  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  18.44 
 
 		 585 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  21.07 
 
 		 609 aa  51.2  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  22.53 
 
 		 542 aa  50.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  26.53 
 
 		 561 aa  50.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1649  hypothetical protein  20.23 
 
 		 352 aa  50.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  20.21 
 
 		 616 aa  50.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  23.71 
 
 		 227 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  23.3 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  23.84 
 
 		 610 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  21.82 
 
 		 591 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  18.28 
 
 		 608 aa  48.9  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  24.58 
 
 		 567 aa  48.5  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>