More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0542 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  80.65 
 
 		 250 aa  417  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  75.5 
 
 		 250 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  76.31 
 
 		 250 aa  394  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  76.71 
 
 		 250 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  75.5 
 
 		 250 aa  394  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  77.2 
 
 		 250 aa  384  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  56.15 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  54.03 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  52.82 
 
 		 247 aa  271  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  52.17 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  49.8 
 
 		 249 aa  269  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  52.02 
 
 		 247 aa  268  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  52.02 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  51.61 
 
 		 247 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  54.13 
 
 		 247 aa  265  7e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  52.02 
 
 		 247 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  265  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  51.6 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  51.6 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  53.06 
 
 		 248 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  50.4 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  258  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  50.6 
 
 		 250 aa  258  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  48 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  53.33 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  50.79 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  50.4 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  52.02 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  52.02 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  52.02 
 
 		 248 aa  254  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  51.22 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  49 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  53.11 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  50.6 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  51.61 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  49.6 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  51.21 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  49 
 
 		 252 aa  252  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  49 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  47.6 
 
 		 249 aa  251  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  52.74 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  49 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  51.59 
 
 		 251 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  50.4 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  48.39 
 
 		 249 aa  248  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  51.24 
 
 		 241 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  48.59 
 
 		 248 aa  248  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  49.8 
 
 		 252 aa  248  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  50 
 
 		 250 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  49.2 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  53.94 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  50.41 
 
 		 243 aa  246  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  53.2 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  48.59 
 
 		 249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  50.99 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  49.38 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  52.85 
 
 		 250 aa  245  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  49 
 
 		 249 aa  244  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  49.2 
 
 		 252 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  49 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  47.01 
 
 		 250 aa  244  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  49.02 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  50 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  49.59 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  52.32 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  48.61 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  48 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  49.4 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  48.41 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  48.56 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  48.77 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  48.59 
 
 		 249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  50.2 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  50.42 
 
 		 239 aa  242  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  50 
 
 		 239 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  50 
 
 		 239 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  49.8 
 
 		 250 aa  241  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  48.19 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  47.79 
 
 		 249 aa  241  7e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  49.6 
 
 		 249 aa  241  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  48.4 
 
 		 251 aa  241  9e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  48.59 
 
 		 249 aa  241  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  45.56 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  48.15 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2110  protein of unknown function DUF28  50 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  49.19 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  48.77 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  48 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  52 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  50.58 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>