More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0375 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
383 aa  788    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
367 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
373 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
395 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
415 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
395 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
383 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
394 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
904 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
386 aa  102  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
426 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
378 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
414 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.56 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.69 
 
 
406 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 
359 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
394 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.43 
 
 
406 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
395 aa  96.3  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
426 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  23.55 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.69 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.62 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  24.43 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
365 aa  94.7  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  24.15 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 
360 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  24.43 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
1302 aa  93.6  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  25.9 
 
 
414 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 
410 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  24.15 
 
 
406 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  23.96 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  23.96 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
381 aa  90.5  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
407 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
360 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
381 aa  89.7  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
385 aa  89.7  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
473 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
406 aa  89  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
454 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
452 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  21.1 
 
 
417 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
385 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
375 aa  86.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  24.16 
 
 
935 aa  86.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
410 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
409 aa  82.8  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  29.35 
 
 
374 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
536 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  23.8 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
446 aa  79.7  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  25 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
387 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.62 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>