More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11930 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 
354 aa  734    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  44.34 
 
 
328 aa  279  6e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  43.17 
 
 
352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 
862 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 
324 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 
323 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  25.24 
 
 
328 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 
325 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 
310 aa  123  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 
350 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.2 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 
314 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  27.04 
 
 
334 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  25.71 
 
 
348 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  27.89 
 
 
331 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 
324 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 
324 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 
339 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  26.65 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  25.16 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  25.38 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  27.03 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  26.16 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  27.49 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  28.57 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  24.93 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  28.03 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  26.86 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  26.67 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  26.48 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  26.48 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  25.8 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  26.48 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  24.06 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  25.8 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  26.49 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  25.57 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  25.16 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  25.44 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  25.44 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  26.59 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.51 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  25.42 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  31.11 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  24.71 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  26.46 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 
356 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 
243 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  23.62 
 
 
353 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 
325 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 
363 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  25.72 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  25.14 
 
 
358 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  25.76 
 
 
362 aa  62.8  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  26.9 
 
 
326 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
354 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 
243 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 
568 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 
568 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  31.46 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  31.46 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 
305 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>