More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10020 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  81.07 
 
 		 206 aa  329  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16240  LSU ribosomal protein L3P  73.79 
 
 		 206 aa  293  9e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0560879  hitchhiker  0.00000737829 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  62.14 
 
 		 206 aa  270  8.000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  58.62 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  56.04 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 216 aa  232  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 216 aa  231  7.000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 218 aa  230  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  53.2 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  52.91 
 
 		 222 aa  229  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  51.46 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  52.2 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  53.88 
 
 		 219 aa  224  8e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  52.91 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 236 aa  222  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 223 aa  222  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 219 aa  221  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 221 aa  221  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  51.94 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 211 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  218  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  53.2 
 
 		 235 aa  216  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  50 
 
 		 217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 220 aa  214  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  55.39 
 
 		 212 aa  214  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 219 aa  214  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  51.24 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 207 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  51.24 
 
 		 209 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  50.75 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  53.65 
 
 		 209 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  50.75 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 212 aa  211  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  211  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  53.12 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  51.96 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  52.24 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  52.24 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  52.24 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 210 aa  207  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 209 aa  207  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  207  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  207  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  47.52 
 
 		 207 aa  207  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  54.41 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 211 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  52.08 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  46.8 
 
 		 211 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 210 aa  205  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  52.08 
 
 		 209 aa  205  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  51.81 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2155  50S ribosomal protein L3P  50.49 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00587716  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  52.08 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>