222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09150 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  637    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  51.79 
 
 
309 aa  310  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  50.81 
 
 
308 aa  309  4e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  48.71 
 
 
311 aa  296  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  37.46 
 
 
342 aa  205  6e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  32.87 
 
 
291 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  32.4 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  31.34 
 
 
287 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  31.76 
 
 
292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  32.41 
 
 
291 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.31 
 
 
286 aa  142  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  32.41 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  30.21 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  31.58 
 
 
287 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  30.56 
 
 
294 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  29.86 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  29.17 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  29.35 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  29.17 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  29.19 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  28.82 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  28.82 
 
 
286 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  28.82 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  28.82 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  29.31 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  28.82 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  29.66 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  27.46 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  32.06 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  32.64 
 
 
286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  28.67 
 
 
285 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  29.97 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  29.97 
 
 
297 aa  125  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  28.92 
 
 
281 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  28.52 
 
 
295 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  29.07 
 
 
289 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  27.02 
 
 
294 aa  123  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  29.59 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  28.21 
 
 
279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  29.41 
 
 
281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  30.45 
 
 
286 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  28.83 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  29.55 
 
 
281 aa  112  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  27.56 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  27.76 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  29.51 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  28.83 
 
 
281 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  26.86 
 
 
280 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  30.5 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  29.51 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  26.5 
 
 
280 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  26.5 
 
 
280 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  28.42 
 
 
295 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  26.5 
 
 
280 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  26.15 
 
 
280 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  26.15 
 
 
280 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  26.15 
 
 
280 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  26.5 
 
 
280 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  28.22 
 
 
279 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  26.15 
 
 
280 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  26.15 
 
 
280 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  28.57 
 
 
282 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  26.3 
 
 
283 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.95 
 
 
281 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  26.39 
 
 
279 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  26.55 
 
 
279 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  28.17 
 
 
282 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  26.07 
 
 
282 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  27.84 
 
 
281 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  27.87 
 
 
637 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  25.95 
 
 
291 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  26.04 
 
 
279 aa  99  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  28.17 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  25.91 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  27.82 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  28.07 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  26.79 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  28.21 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  28.18 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  26.45 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  23.86 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  28.37 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  26.83 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  27.61 
 
 
311 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  26.41 
 
 
282 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  26.55 
 
 
282 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  33.48 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  26.39 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  25.69 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  26.83 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1522  hypothetical protein  28.62 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.487789  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  24.38 
 
 
284 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  28.52 
 
 
283 aa  90.1  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  25.44 
 
 
310 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  30.51 
 
 
285 aa  89.4  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  27.72 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3161  degV family protein  28.12 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  26.22 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  24.83 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  27.95 
 
 
285 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>