More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06770 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  66.62 
 
 		 690 aa  927    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  100 
 
 		 668 aa  1369    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  51.26 
 
 		 672 aa  669    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  66.47 
 
 		 709 aa  912    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 663 aa  556  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 663 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  42.53 
 
 		 685 aa  552  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  44.07 
 
 		 645 aa  535  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  43.77 
 
 		 645 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  42.11 
 
 		 649 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  42.1 
 
 		 648 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  42.4 
 
 		 648 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  42.71 
 
 		 641 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  41.69 
 
 		 649 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  45.2 
 
 		 549 aa  495  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 767 aa  481  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 		 545 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  44.57 
 
 		 548 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  44.38 
 
 		 548 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  44.18 
 
 		 540 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  44.19 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  43.63 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  45.44 
 
 		 544 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  44.32 
 
 		 543 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  43.97 
 
 		 540 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  43.58 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  44.32 
 
 		 542 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  46.31 
 
 		 536 aa  468  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  44.49 
 
 		 539 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  43.36 
 
 		 540 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  44.81 
 
 		 540 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  43.81 
 
 		 540 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  44.67 
 
 		 540 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  44.38 
 
 		 540 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  43.6 
 
 		 540 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.07 
 
 		 541 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  43.99 
 
 		 540 aa  465  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  44.49 
 
 		 540 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  44.01 
 
 		 540 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  43.81 
 
 		 540 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  44.51 
 
 		 540 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 540 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 545 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  43.18 
 
 		 540 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  43.7 
 
 		 543 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  43.55 
 
 		 540 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  44.84 
 
 		 619 aa  461  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  42.67 
 
 		 565 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  41.73 
 
 		 642 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 		 641 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  43.07 
 
 		 560 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  36.79 
 
 		 646 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  43.58 
 
 		 540 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  37.37 
 
 		 643 aa  449  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  38.97 
 
 		 688 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  42.8 
 
 		 564 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 		 632 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.72 
 
 		 645 aa  443  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  42.96 
 
 		 581 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  38.42 
 
 		 667 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  42.86 
 
 		 630 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  40.87 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  41.2 
 
 		 664 aa  440  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  37.52 
 
 		 656 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  36.24 
 
 		 638 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  42.75 
 
 		 637 aa  438  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  43.84 
 
 		 567 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  41.5 
 
 		 575 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  43.17 
 
 		 564 aa  428  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  36.76 
 
 		 666 aa  425  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  37.56 
 
 		 667 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  39.78 
 
 		 545 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  42.08 
 
 		 569 aa  416  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  38.52 
 
 		 544 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  40.75 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  40.56 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  42.06 
 
 		 574 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  36.94 
 
 		 541 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  36.75 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 536 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  36.54 
 
 		 636 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  38.35 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  38 
 
 		 643 aa  403  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  35.03 
 
 		 645 aa  402  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 641 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  40.19 
 
 		 575 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  35.99 
 
 		 659 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  36.01 
 
 		 658 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  35.29 
 
 		 648 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  36.79 
 
 		 659 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  38.43 
 
 		 540 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  34.83 
 
 		 634 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 		 658 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  41.09 
 
 		 583 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  34.89 
 
 		 659 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  40.22 
 
 		 651 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  34.23 
 
 		 636 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2379  ABC transporter related  36.41 
 
 		 660 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  40.22 
 
 		 574 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>