268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2562 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  42.14 
 
 
287 aa  249  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  29.93 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 
317 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  32.74 
 
 
283 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  28.94 
 
 
283 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  28.94 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  32.68 
 
 
274 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  30.63 
 
 
276 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  26.1 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  26.64 
 
 
283 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  32.84 
 
 
273 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  25.55 
 
 
283 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  27.56 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  26.1 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  26.47 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  26.47 
 
 
283 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  27.52 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  24.82 
 
 
283 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 
283 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  24.82 
 
 
283 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 
291 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  28.67 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  29.91 
 
 
271 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  27.41 
 
 
281 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  28.15 
 
 
288 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 
273 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  33.49 
 
 
274 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  28.69 
 
 
283 aa  103  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 
272 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  27.9 
 
 
274 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  25.35 
 
 
277 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 
274 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  27.18 
 
 
285 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  27.4 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  32.34 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  27.82 
 
 
288 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  26.27 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  25.32 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  27.74 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  27.74 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  26.05 
 
 
348 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  25.82 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 
356 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  25.63 
 
 
348 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 
336 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  25.9 
 
 
359 aa  89  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  31.34 
 
 
292 aa  87  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  23.71 
 
 
357 aa  85.9  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  25.22 
 
 
307 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  25.18 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  23.16 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  25.63 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  23.24 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  26.78 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  24.66 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  24.81 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  29.25 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  26.81 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  27.5 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  25.46 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  27.18 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  25.31 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  25.14 
 
 
306 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  25.46 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  27.71 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  29.1 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  27.36 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  23.15 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  25.79 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  23.26 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  24.15 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  27.84 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  25.89 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  26.15 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  25.37 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  25.85 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  21.82 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  25.57 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  24.88 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  27.73 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>