198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1645 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 358 aa  723    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  47.85 
 
 		 291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  51.03 
 
 		 293 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  51.75 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  46.81 
 
 		 272 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  41.76 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  46.9 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  50.4 
 
 		 271 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  49.22 
 
 		 271 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  45.62 
 
 		 357 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  47.22 
 
 		 653 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  47.62 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  44.44 
 
 		 653 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  46.85 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  46.1 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  48.41 
 
 		 285 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  41.82 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 509 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  47.62 
 
 		 538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  47.76 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  46.88 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  43.88 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  46.46 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  43.24 
 
 		 288 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  39.77 
 
 		 286 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  41.36 
 
 		 271 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  44.44 
 
 		 667 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  47.73 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  45.93 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  48.48 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  43.62 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  36.32 
 
 		 428 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  45.31 
 
 		 283 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  46.62 
 
 		 430 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  48.72 
 
 		 562 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  43.88 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  45.16 
 
 		 283 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  48.7 
 
 		 653 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  45.08 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  43.08 
 
 		 568 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  38.24 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  45.86 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  45.38 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  39.62 
 
 		 549 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  43.42 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  46.88 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  43.66 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  38.75 
 
 		 559 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  46.96 
 
 		 655 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  34.2 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  43.08 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  44.62 
 
 		 292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  42.68 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  43.85 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  43.95 
 
 		 424 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  41.28 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  42.28 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  45.16 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  42.47 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  44.26 
 
 		 689 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  42.42 
 
 		 284 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  43.75 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  34.3 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  41.22 
 
 		 694 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  41.74 
 
 		 295 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  42.02 
 
 		 275 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  34.67 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 638 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  44.54 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  45.95 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  38.36 
 
 		 231 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  35.67 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  37.58 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  41.8 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  35.76 
 
 		 510 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  40.16 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  43.1 
 
 		 445 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  42.24 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  40.62 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  38.58 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  37.76 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 580 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  37.33 
 
 		 377 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  33.13 
 
 		 523 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0363  anti-sigma-factor antagonist  39.06 
 
 		 279 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.700389  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  39.53 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 521 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  39.72 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  41.54 
 
 		 506 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  42.19 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  35.53 
 
 		 365 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 511 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  37.76 
 
 		 385 aa  92.8  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  36.81 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  40.65 
 
 		 261 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>