271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0065 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  100 
 
 
405 aa  811  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  52.5 
 
 
398 aa  406  1e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  53.02 
 
 
394 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  52.58 
 
 
411 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  45.58 
 
 
424 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  37.53 
 
 
420 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  34.57 
 
 
413 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  36.44 
 
 
397 aa  213  3e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  27.91 
 
 
351 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  31.6 
 
 
411 aa  85.9  1e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  31.91 
 
 
322 aa  75.5  2e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  24.4 
 
 
740 aa  75.1  2e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  29.92 
 
 
283 aa  72.4  1e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  26.79 
 
 
390 aa  71.2  3e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  31.27 
 
 
419 aa  71.2  3e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  29.97 
 
 
382 aa  70.5  5e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  28.74 
 
 
733 aa  69.3  1e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.94 
 
 
728 aa  68.9  2e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  29.44 
 
 
753 aa  68.9  2e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  27.94 
 
 
751 aa  68.2  3e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  27.02 
 
 
308 aa  67.8  3e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.94 
 
 
728 aa  68.2  3e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  24.69 
 
 
767 aa  67.8  4e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  29.46 
 
 
393 aa  67  5e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  28.73 
 
 
728 aa  67  5e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  30.47 
 
 
419 aa  67  6e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  36.36 
 
 
331 aa  67  6e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  28.36 
 
 
920 aa  66.6  7e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  28.73 
 
 
945 aa  66.6  7e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  28.73 
 
 
930 aa  66.6  7e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  30.47 
 
 
419 aa  66.6  7e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  28.73 
 
 
933 aa  66.6  7e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  30.86 
 
 
309 aa  66.2  9e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.94 
 
 
727 aa  66.2  9e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  2.93733e-06 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  27.51 
 
 
331 aa  66.2  1e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  26.85 
 
 
382 aa  65.1  2e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  27.03 
 
 
389 aa  65.1  2e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  27.13 
 
 
748 aa  65.5  2e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  37.93 
 
 
288 aa  64.7  3e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  31.28 
 
 
298 aa  64.3  4e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  29.92 
 
 
301 aa  62.8  9e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  29.84 
 
 
301 aa  62.4  1e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  29.84 
 
 
301 aa  62.4  1e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  27.04 
 
 
320 aa  62.4  1e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  26.73 
 
 
389 aa  62.4  1e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  30.43 
 
 
288 aa  62.4  1e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  27.04 
 
 
320 aa  62.8  1e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  28.76 
 
 
311 aa  62  2e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  25.72 
 
 
323 aa  61.6  2e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  28.69 
 
 
777 aa  61.6  2e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 
347 aa  62  2e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  2.14716e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  28.24 
 
 
296 aa  62.4  2e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  33.47 
 
 
381 aa  61.6  2e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  32.54 
 
 
306 aa  61.6  3e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  1.89293e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  26.61 
 
 
333 aa  61.2  3e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  32.54 
 
 
347 aa  61.2  3e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  4.73323e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  32.54 
 
 
347 aa  61.2  3e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  32.54 
 
 
347 aa  61.2  3e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  32.54 
 
 
474 aa  61.2  3e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  4.6656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  32.54 
 
 
347 aa  61.2  3e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  33.09 
 
 
330 aa  61.2  3e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  1.89708e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  36.11 
 
 
316 aa  60.8  4e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  27.59 
 
 
303 aa  60.8  4e-08  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  32.54 
 
 
302 aa  60.5  5e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  32.54 
 
 
302 aa  60.5  5e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  26.79 
 
 
798 aa  60.1  6e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95852e-07 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  27.97 
 
 
714 aa  60.1  6e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  29.96 
 
 
728 aa  60.1  6e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  30.22 
 
 
728 aa  60.5  6e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  26.97 
 
 
852 aa  60.1  7e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  31.75 
 
 
305 aa  59.7  8e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.44738e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  31.75 
 
 
305 aa  59.7  8e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  31.75 
 
 
306 aa  59.7  8e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  27.89 
 
 
804 aa  59.3  1e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  26.79 
 
 
796 aa  59.7  1e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  26.1 
 
 
382 aa  58.9  1e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  27.09 
 
 
667 aa  58.9  1e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  32.54 
 
 
349 aa  59.7  1e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  2.27608e-05  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  26.79 
 
 
331 aa  58.2  2e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  26.1 
 
 
382 aa  58.5  2e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  31.75 
 
 
358 aa  58.2  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  39.18 
 
 
283 aa  58.2  2e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  29.15 
 
 
391 aa  58.5  2e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  30.84 
 
 
293 aa  57.8  3e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  28.84 
 
 
421 aa  58.2  3e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  36.11 
 
 
311 aa  58.2  3e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  30.95 
 
 
308 aa  57.4  4e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  26.69 
 
 
803 aa  57  5e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  2.95709e-05 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  26.69 
 
 
803 aa  57  5e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  27.44 
 
 
383 aa  57.4  5e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  26.69 
 
 
803 aa  57  5e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  29.22 
 
 
729 aa  57.4  5e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  30.34 
 
 
294 aa  57  6e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  34.58 
 
 
348 aa  57  6e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  29.91 
 
 
302 aa  57  6e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  26.79 
 
 
813 aa  56.6  7e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  27.35 
 
 
790 aa  56.2  9e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  28.26 
 
 
317 aa  56.6  9e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  30.56 
 
 
317 aa  55.8  1e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  7.66649e-06  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  33.6 
 
 
223 aa  56.2  1e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>