More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0290 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  47.97 
 
 
923 aa  888  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  43.75 
 
 
909 aa  781  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  48.75 
 
 
875 aa  848  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  50.48 
 
 
894 aa  926  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  100 
 
 
981 aa  2016  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  49.95 
 
 
950 aa  900  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  44.33 
 
 
900 aa  765  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33.99 
 
 
728 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  33.05 
 
 
751 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  6.72418e-09 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.5 
 
 
727 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  2.93733e-06 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.01 
 
 
751 aa  182  3e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  32.53 
 
 
728 aa  181  5e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  33.41 
 
 
728 aa  181  5e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  38.38 
 
 
728 aa  180  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  32.83 
 
 
735 aa  177  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.55516e-06  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.14 
 
 
728 aa  177  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  33.5 
 
 
737 aa  177  1e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  32.35 
 
 
740 aa  175  3e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  33.25 
 
 
738 aa  174  7e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  33.75 
 
 
733 aa  173  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  32.13 
 
 
738 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  32.13 
 
 
738 aa  173  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  31.74 
 
 
739 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  32.06 
 
 
738 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  35.6 
 
 
735 aa  168  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  32.06 
 
 
737 aa  168  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  32.06 
 
 
738 aa  168  6e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.66561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  32.06 
 
 
738 aa  168  6e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  3.04178e-12 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  36.96 
 
 
767 aa  166  1e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  31.18 
 
 
736 aa  166  2e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  39.29 
 
 
790 aa  164  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  33.79 
 
 
740 aa  163  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  32.54 
 
 
720 aa  162  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.42926e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  31.57 
 
 
750 aa  160  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  30.83 
 
 
734 aa  158  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  37.33 
 
 
852 aa  157  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  34.23 
 
 
741 aa  157  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  31.01 
 
 
738 aa  157  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  36.15 
 
 
737 aa  156  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  37.46 
 
 
920 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  37.46 
 
 
945 aa  156  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  37.46 
 
 
930 aa  156  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  37.46 
 
 
728 aa  156  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  37.46 
 
 
933 aa  156  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  37.68 
 
 
667 aa  155  3e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  35.96 
 
 
754 aa  155  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  37.72 
 
 
745 aa  152  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  35.56 
 
 
813 aa  151  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  35 
 
 
803 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  2.95709e-05 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  35 
 
 
803 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  37.93 
 
 
714 aa  150  1e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  36.25 
 
 
804 aa  149  2e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  36.13 
 
 
771 aa  149  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  34.74 
 
 
803 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  29.28 
 
 
733 aa  147  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  37.16 
 
 
796 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  37.16 
 
 
776 aa  147  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  34.21 
 
 
707 aa  147  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  37.16 
 
 
798 aa  147  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95852e-07 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  35.67 
 
 
753 aa  145  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  35.44 
 
 
777 aa  143  2e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  29.8 
 
 
746 aa  141  5e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  1.24103e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  30.13 
 
 
748 aa  140  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  30.04 
 
 
760 aa  138  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  27.52 
 
 
775 aa  134  1e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  33 
 
 
745 aa  130  1e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  34.63 
 
 
764 aa  129  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  32.7 
 
 
310 aa  127  8e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  29.41 
 
 
256 aa  127  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  30.39 
 
 
311 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  28.23 
 
 
272 aa  122  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  32.21 
 
 
347 aa  119  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  32.21 
 
 
474 aa  119  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  4.6656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  32.21 
 
 
347 aa  119  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  32.21 
 
 
306 aa  119  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  1.89293e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  32.21 
 
 
347 aa  119  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  2.14716e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  35.62 
 
 
315 aa  119  4e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  29.02 
 
 
333 aa  119  4e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  34.53 
 
 
323 aa  117  1e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  26.94 
 
 
275 aa  115  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  31.82 
 
 
358 aa  115  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  30.56 
 
 
308 aa  115  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  27.69 
 
 
310 aa  115  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  33.64 
 
 
323 aa  115  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  29.62 
 
 
259 aa  114  7e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  29.1 
 
 
318 aa  114  1e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  26.83 
 
 
260 aa  114  1e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  30.77 
 
 
302 aa  113  2e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  26.21 
 
 
275 aa  113  2e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  28.76 
 
 
320 aa  113  2e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  30.3 
 
 
305 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.44738e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  28.32 
 
 
320 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30.6 
 
 
311 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  30.3 
 
 
305 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  30.3 
 
 
306 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  29.15 
 
 
324 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  28.32 
 
 
320 aa  112  4e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  31.1 
 
 
318 aa  112  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  30.23 
 
 
349 aa  112  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  2.27608e-05  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  28.87 
 
 
253 aa  111  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.06968e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>