195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4234 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  100 
 
 		 608 aa  1249    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  63.16 
 
 		 622 aa  834    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  70.84 
 
 		 607 aa  894    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  70.68 
 
 		 607 aa  914    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  73.43 
 
 		 614 aa  931    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  70.68 
 
 		 607 aa  892    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  72.77 
 
 		 614 aa  923    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  70.84 
 
 		 611 aa  902    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  71.33 
 
 		 614 aa  906    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  72.61 
 
 		 614 aa  923    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  72.77 
 
 		 617 aa  924    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  41.81 
 
 		 627 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  45.05 
 
 		 615 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  45.23 
 
 		 615 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  42.06 
 
 		 614 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  42.73 
 
 		 615 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  44.49 
 
 		 615 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  44.3 
 
 		 628 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  42.31 
 
 		 617 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  43.09 
 
 		 613 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  41.7 
 
 		 618 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  42.52 
 
 		 613 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  43.77 
 
 		 616 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  43.58 
 
 		 616 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  43.58 
 
 		 616 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  42.88 
 
 		 617 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  43.53 
 
 		 625 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  43.4 
 
 		 616 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1649  hypothetical protein  60.51 
 
 		 352 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  42.69 
 
 		 624 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  41.73 
 
 		 602 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  43.08 
 
 		 618 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  82.3 
 
 		 227 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  40.94 
 
 		 625 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  37.94 
 
 		 633 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  43.22 
 
 		 605 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  40.99 
 
 		 629 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  37.79 
 
 		 628 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  36.38 
 
 		 630 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  34.86 
 
 		 628 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  36.56 
 
 		 621 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  40.83 
 
 		 1283 aa  357  5e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  36.99 
 
 		 635 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  38.43 
 
 		 585 aa  353  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  36.99 
 
 		 635 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  36.07 
 
 		 609 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  36.81 
 
 		 635 aa  351  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  36.69 
 
 		 609 aa  351  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  36.07 
 
 		 609 aa  349  8e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  35.29 
 
 		 609 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  37.87 
 
 		 609 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  36.07 
 
 		 609 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  36.58 
 
 		 616 aa  346  8e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  36.04 
 
 		 609 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  36.04 
 
 		 609 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  35.71 
 
 		 605 aa  345  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  36.04 
 
 		 609 aa  343  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  34.53 
 
 		 611 aa  343  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  35.68 
 
 		 611 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  36.75 
 
 		 616 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  36.4 
 
 		 609 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  33.88 
 
 		 607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  37.97 
 
 		 639 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  34.17 
 
 		 609 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  34.04 
 
 		 610 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  36.15 
 
 		 636 aa  327  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  34.89 
 
 		 604 aa  313  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  33.71 
 
 		 583 aa  307  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  34.67 
 
 		 594 aa  308  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  36.28 
 
 		 614 aa  306  6e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  32.87 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  37.32 
 
 		 610 aa  301  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  37.14 
 
 		 611 aa  301  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  34.15 
 
 		 605 aa  296  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  32.14 
 
 		 603 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  32.14 
 
 		 603 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  31.38 
 
 		 601 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  32.13 
 
 		 603 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  31.97 
 
 		 603 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  31.21 
 
 		 601 aa  293  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  33.07 
 
 		 629 aa  292  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  31.99 
 
 		 619 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  31.21 
 
 		 601 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  33.52 
 
 		 592 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  38.05 
 
 		 608 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  33.08 
 
 		 619 aa  289  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  31.9 
 
 		 601 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  37.83 
 
 		 608 aa  289  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  34.12 
 
 		 621 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  31.36 
 
 		 599 aa  289  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  32.1 
 
 		 595 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  33.64 
 
 		 589 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  31.78 
 
 		 602 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  31.83 
 
 		 603 aa  287  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  32.44 
 
 		 635 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  32.55 
 
 		 599 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  34.23 
 
 		 591 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  32.44 
 
 		 637 aa  283  8.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  33.9 
 
 		 599 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  31.51 
 
 		 587 aa  280  8e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>