46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL03890 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  100 
 
 		 131 aa  259  8.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  60.24 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  50 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.200547 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  48.75 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  46.15 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  49.28 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  45.45 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  42.03 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  44.62 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  45 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  37.14 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  47.83 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  36.36 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  31.51 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  40.68 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.67 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  41.54 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  41.67 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.33 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.5 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  41.67 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.92 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  40 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.94 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  33.8 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  32.84 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  36.14 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  33.33 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.39 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05400  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm8, putative  35.21 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  30 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  35.38 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.38 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.67 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  38.46 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20588  predicted protein  42.86 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10752  predicted protein  37.88 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  42.62 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49015  predicted protein  40.3 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.205612  decreased coverage  0.0032819 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  34.25 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  41.82 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02920  small nuclear ribonucleoprotein E, putative  40.82 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0578232  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  38.81 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  48.94 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47366  predicted protein  40.43 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>