84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03070 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  61.58 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  58.46 
 
 		 217 aa  235  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  54.69 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  49.04 
 
 		 232 aa  194  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  42.79 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  35.96 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  29.1 
 
 		 272 aa  99  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  27.68 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  29.47 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  28.57 
 
 		 267 aa  90.1  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  29.79 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  29.33 
 
 		 282 aa  87.8  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  28.5 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  28.74 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  28.09 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  31.11 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  31.11 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  29.06 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  30.11 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  30.11 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  29.21 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  29.38 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  23.91 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  28.19 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  27.07 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  30.17 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  27.53 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  26.32 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  29.14 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  29.57 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  27.65 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  27.17 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.74 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  27.91 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  30.81 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  30.23 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  30 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  26.82 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  26.4 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.09 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  24.86 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.53 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  27.03 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  28.41 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.4 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  25.81 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  27.01 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  25.41 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  26.7 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  22.58 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.6 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  24.57 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  26.64 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  29.82 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  28.71 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10708  hypothetical proteasome beta 7 subunit (Eurofung)  26.67 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  24.72 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  27.43 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  26.26 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  24.16 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  25.14 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  22.7 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  26.86 
 
 		 283 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  24.4 
 
 		 288 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  25.13 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  25.71 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  24.15 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  24.73 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  23.46 
 
 		 290 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  21.94 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  23.19 
 
 		 261 aa  48.9  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  21.89 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  26.38 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  25 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  22.98 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  24.16 
 
 		 276 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  22.63 
 
 		 302 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  21.08 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  23.04 
 
 		 284 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  24.57 
 
 		 302 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  26.11 
 
 		 248 aa  42  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  24.02 
 
 		 252 aa  41.6  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  22.58 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>