More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3633 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3410  serine hydroxymethyltransferase  71.9 
 
 		 424 aa  650    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3814  serine hydroxymethyltransferase  75.12 
 
 		 433 aa  692    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.866873  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3859  serine hydroxymethyltransferase  73.33 
 
 		 423 aa  658    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3633  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 431 aa  897    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4970  Glycine hydroxymethyltransferase  75.06 
 
 		 428 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00413503  hitchhiker  0.000000000000204325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7293  Glycine hydroxymethyltransferase  69.29 
 
 		 425 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1617  serine hydroxymethyltransferase  69.05 
 
 		 424 aa  622  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09233  serine hydroxymethyltransferase  67.22 
 
 		 439 aa  616  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0275  serine hydroxymethyltransferase  67.06 
 
 		 422 aa  614  9.999999999999999e-175  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.246164 
 
 
-
 
NC_002950  PG0042  serine hydroxymethyltransferase  64.45 
 
 		 426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1965  serine hydroxymethyltransferase  60.94 
 
 		 441 aa  548  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0601  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0584  serine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 		 440 aa  544  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130889  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0630  serine hydroxymethyltransferase  62.12 
 
 		 440 aa  541  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0727  serine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 		 438 aa  541  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1590  serine hydroxymethyltransferase  60.71 
 
 		 440 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1789  serine hydroxymethyltransferase  60.47 
 
 		 438 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 		 436 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 		 436 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  58.1 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  58.1 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 412 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  53.46 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  55.13 
 
 		 416 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  54.42 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  54.42 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  54.19 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 415 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 411 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  54.98 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 		 415 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 410 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  52.79 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 414 aa  461  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 411 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  52.35 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  53.33 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 410 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  54.19 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  54.48 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  54.42 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  52.74 
 
 		 427 aa  461  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  53.41 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1647  serine hydroxymethyltransferase  52.98 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  54.19 
 
 		 416 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  54.29 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  53.83 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  55.19 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2910  glycine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  55.13 
 
 		 419 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  52.74 
 
 		 415 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  52.35 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  53.3 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0615  serine hydroxymethyltransferase  52.51 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  53.26 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  54.05 
 
 		 411 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  52.17 
 
 		 429 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  53.3 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 412 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  51.19 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  52.83 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  53.02 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  53.83 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  52.62 
 
 		 420 aa  458  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  51.95 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1141  serine hydroxymethyltransferase  53.46 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.217478  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  51.86 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  53.44 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  52.73 
 
 		 419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>