More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3277 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  62.3 
 
 		 254 aa  335  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  62.7 
 
 		 253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  60.96 
 
 		 254 aa  315  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  52.38 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  52.63 
 
 		 256 aa  259  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  51.39 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 250 aa  245  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 257 aa  243  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.96 
 
 		 646 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1507  hypothetical protein  45.63 
 
 		 267 aa  241  7e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  49.19 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  48.79 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  48.98 
 
 		 255 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6209  triosephosphate isomerase  60.22 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.74008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 266 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 655 aa  230  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  48.54 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  48.12 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 251 aa  228  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 251 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  46.61 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 252 aa  225  7e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 251 aa  224  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  46.94 
 
 		 251 aa  224  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  46.22 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  46.61 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  49.2 
 
 		 255 aa  222  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  221  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  221  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  221  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  221  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  46.85 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 650 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  45.24 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  47.67 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>