More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1610 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1610  DNA primase  100 
 
 		 548 aa  1115    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  51.36 
 
 		 554 aa  543  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  49.18 
 
 		 546 aa  523  1e-147  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  45.23 
 
 		 572 aa  483  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  46.55 
 
 		 595 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  48.11 
 
 		 605 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  48.11 
 
 		 605 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  48.11 
 
 		 614 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  40.69 
 
 		 552 aa  390  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  38.45 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  42.32 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  37.43 
 
 		 617 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.19 
 
 		 595 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.68 
 
 		 599 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  38.44 
 
 		 655 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  34.99 
 
 		 539 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  37.53 
 
 		 656 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  39.04 
 
 		 660 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  39 
 
 		 652 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  37.54 
 
 		 614 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  38.27 
 
 		 601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  35.05 
 
 		 663 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  39.04 
 
 		 660 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  38.29 
 
 		 666 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  36.02 
 
 		 583 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  38.76 
 
 		 660 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.73 
 
 		 583 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  39.04 
 
 		 660 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.04 
 
 		 664 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  36.65 
 
 		 638 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  38.44 
 
 		 651 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  37.6 
 
 		 663 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  37.86 
 
 		 633 aa  242  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  36.44 
 
 		 582 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0213  DNA primase  33.94 
 
 		 677 aa  242  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387013  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  33.51 
 
 		 544 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  37.46 
 
 		 579 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  34.93 
 
 		 577 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  35.61 
 
 		 574 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  35.61 
 
 		 574 aa  240  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  36.41 
 
 		 574 aa  241  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 604 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  35.22 
 
 		 679 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  35.61 
 
 		 574 aa  241  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0504  DNA primase  34.92 
 
 		 604 aa  240  5e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.188131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  34.7 
 
 		 578 aa  240  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  31.1 
 
 		 684 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  35.35 
 
 		 574 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  35.01 
 
 		 574 aa  239  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  33.79 
 
 		 574 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  34.85 
 
 		 574 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  39.71 
 
 		 595 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  39.71 
 
 		 595 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  32.36 
 
 		 645 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  34.6 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  34.85 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  34.34 
 
 		 686 aa  237  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  35.01 
 
 		 601 aa  237  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  35.22 
 
 		 581 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  35.22 
 
 		 581 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  35.22 
 
 		 581 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  35.22 
 
 		 581 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  35.22 
 
 		 581 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  36.7 
 
 		 553 aa  236  8e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  33.87 
 
 		 682 aa  236  8e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  36.7 
 
 		 572 aa  236  8e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.25 
 
 		 598 aa  236  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.31 
 
 		 587 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  33.94 
 
 		 595 aa  235  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  34.55 
 
 		 581 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  34.55 
 
 		 581 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  34.55 
 
 		 581 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  32.8 
 
 		 577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  33.26 
 
 		 675 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  37.32 
 
 		 632 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  34.55 
 
 		 581 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  34.55 
 
 		 581 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  34.55 
 
 		 581 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  32.85 
 
 		 652 aa  234  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  36.77 
 
 		 576 aa  234  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  34.55 
 
 		 581 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl269  DNA primase  35.56 
 
 		 626 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000470008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  30.87 
 
 		 601 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  35.73 
 
 		 660 aa  233  6e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  31.55 
 
 		 584 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  35.48 
 
 		 577 aa  233  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  34.65 
 
 		 596 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  32.99 
 
 		 629 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.06 
 
 		 588 aa  233  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  37.1 
 
 		 656 aa  233  9e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  34.72 
 
 		 581 aa  233  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  33.69 
 
 		 560 aa  233  9e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  32.37 
 
 		 587 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  33.82 
 
 		 626 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  35.76 
 
 		 582 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  38.14 
 
 		 588 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  32.53 
 
 		 573 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  35.1 
 
 		 575 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  34.29 
 
 		 581 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  34.29 
 
 		 581 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>