228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0414 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  100 
 
 
411 aa  806    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  41.56 
 
 
412 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  39.61 
 
 
409 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 
417 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  39.95 
 
 
431 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  39.95 
 
 
430 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  40.21 
 
 
432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
454 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  41.67 
 
 
436 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  38.94 
 
 
446 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  36.25 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  34.98 
 
 
444 aa  243  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 
436 aa  243  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  37.53 
 
 
447 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  36.12 
 
 
416 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  35.56 
 
 
471 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  33.33 
 
 
427 aa  223  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
430 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  37.1 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  34.79 
 
 
421 aa  219  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  34.45 
 
 
427 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  37.43 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  35.64 
 
 
429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  33.5 
 
 
713 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  34.08 
 
 
418 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  30.9 
 
 
412 aa  203  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  34.16 
 
 
452 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  30.29 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  30.66 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  29.95 
 
 
726 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  34.8 
 
 
418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  34.8 
 
 
418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  31.71 
 
 
397 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  30.45 
 
 
429 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  30.28 
 
 
429 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  31.97 
 
 
444 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  32.02 
 
 
424 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  32.52 
 
 
433 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  34.06 
 
 
438 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  36.44 
 
 
520 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  33.74 
 
 
447 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  34.39 
 
 
444 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  34.39 
 
 
446 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
432 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  36.44 
 
 
420 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  32.31 
 
 
443 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  31.33 
 
 
411 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  34.06 
 
 
438 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  29.44 
 
 
417 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  34.26 
 
 
434 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  34.16 
 
 
434 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  30.98 
 
 
390 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  35.14 
 
 
481 aa  186  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  33.58 
 
 
480 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  32.29 
 
 
386 aa  186  9e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  34.5 
 
 
474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  33.58 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  33.42 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  33.58 
 
 
480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  33.99 
 
 
476 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  34.41 
 
 
446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  34.41 
 
 
446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  34.41 
 
 
446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  34.48 
 
 
476 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  32.3 
 
 
426 aa  182  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  34.24 
 
 
474 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  29.61 
 
 
418 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  34.72 
 
 
459 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  33.25 
 
 
473 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  29.61 
 
 
418 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  33.24 
 
 
384 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  32.75 
 
 
465 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  31.25 
 
 
433 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  32.34 
 
 
389 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  33.25 
 
 
474 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  32.35 
 
 
425 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  29.25 
 
 
411 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  31.11 
 
 
389 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  34.02 
 
 
436 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  33.59 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  29.27 
 
 
427 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000082  permease  32.21 
 
 
386 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0172441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  32.31 
 
 
464 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  29.09 
 
 
412 aa  168  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  29.86 
 
 
471 aa  167  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  34.65 
 
 
356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  28.02 
 
 
410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  30 
 
 
385 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  30.38 
 
 
429 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  29.26 
 
 
390 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  29.55 
 
 
390 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  29.26 
 
 
390 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  28.64 
 
 
421 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3908  major facilitator transporter  29.08 
 
 
388 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3835  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
388 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4031  major facilitator transporter  29.08 
 
 
388 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0425  major facilitator transporter  29.08 
 
 
388 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  29.6 
 
 
414 aa  157  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>