More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0388 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 384 aa  761    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  74.61 
 
 		 383 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  74.35 
 
 		 383 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  71.32 
 
 		 384 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  57.84 
 
 		 375 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  56.33 
 
 		 375 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  55.3 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  55.3 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  58.15 
 
 		 375 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  54.38 
 
 		 381 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  55.27 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  52.82 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  53.98 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  53.75 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  53.08 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  54.9 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  55.01 
 
 		 380 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  52.06 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  51.01 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  51.3 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  51.3 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  51.3 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  52.59 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  51.3 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  53.17 
 
 		 374 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  51.04 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  51.03 
 
 		 386 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  50.38 
 
 		 386 aa  361  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  52 
 
 		 383 aa  358  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  51.28 
 
 		 386 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  52.28 
 
 		 377 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  52.49 
 
 		 390 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  50.25 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  51.52 
 
 		 377 aa  349  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  50.75 
 
 		 383 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  49.5 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  51.82 
 
 		 376 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  49.37 
 
 		 380 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  51.32 
 
 		 383 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  48.37 
 
 		 384 aa  342  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  48.87 
 
 		 380 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  49.87 
 
 		 409 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  49.87 
 
 		 409 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  50.62 
 
 		 391 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  48.77 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  47.62 
 
 		 384 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  47.62 
 
 		 384 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  48.87 
 
 		 379 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  49.62 
 
 		 391 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  47.37 
 
 		 384 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  47.37 
 
 		 384 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  47.37 
 
 		 384 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  48.07 
 
 		 383 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  49.87 
 
 		 380 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  50.13 
 
 		 409 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  49.87 
 
 		 380 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  49.87 
 
 		 383 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  50 
 
 		 414 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  46.87 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  50.38 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  48.95 
 
 		 411 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  50.77 
 
 		 362 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  50.77 
 
 		 362 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  50.77 
 
 		 362 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  47.88 
 
 		 394 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  49.49 
 
 		 384 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  51.37 
 
 		 374 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  51.12 
 
 		 374 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  47.86 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  50.87 
 
 		 374 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  48.2 
 
 		 381 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  51.12 
 
 		 374 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  44.9 
 
 		 471 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  50.87 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  50.87 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  50.87 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  50.87 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  48.21 
 
 		 384 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  48.21 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  47.36 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  48.21 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  48.21 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  45.38 
 
 		 403 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  48.21 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  50.26 
 
 		 384 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  50.77 
 
 		 361 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  48.11 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  45 
 
 		 419 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  45 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  45 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  45 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  45 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  49.75 
 
 		 374 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>