More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5279 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  100 
 
 		 385 aa  773    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  68.32 
 
 		 383 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  66.41 
 
 		 390 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  67.28 
 
 		 383 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  63.9 
 
 		 402 aa  471  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  63.9 
 
 		 402 aa  472  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  62.27 
 
 		 383 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  61.9 
 
 		 383 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  63.02 
 
 		 393 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  62.34 
 
 		 403 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  58.7 
 
 		 385 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  57.89 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  58.76 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  55 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  57.4 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  51.95 
 
 		 389 aa  362  8e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  50.42 
 
 		 382 aa  342  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  52.91 
 
 		 381 aa  338  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  49.34 
 
 		 382 aa  324  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  48.29 
 
 		 383 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  49.74 
 
 		 384 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  42.86 
 
 		 380 aa  302  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  43.98 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  47.37 
 
 		 391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  48.69 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  42.33 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  43.27 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  42.26 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  41.8 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  45.24 
 
 		 389 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  44.3 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  44.59 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  41.27 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  43.16 
 
 		 391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  43.92 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  45.03 
 
 		 390 aa  265  7e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  41.84 
 
 		 388 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  42.04 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  43.65 
 
 		 382 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  45.45 
 
 		 385 aa  262  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  42.66 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  44.59 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  43.82 
 
 		 382 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.53 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.3 
 
 		 380 aa  256  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  41.16 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  42.71 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  39.21 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  41.58 
 
 		 389 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  38.61 
 
 		 378 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  40.22 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  39.1 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  39.16 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.95 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.79 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.46 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.46 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  35.13 
 
 		 390 aa  202  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  36.49 
 
 		 390 aa  201  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  38.1 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  34.16 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  36.99 
 
 		 383 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  35.85 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  36.22 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  36.99 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  36.48 
 
 		 390 aa  193  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  39.53 
 
 		 378 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  35.67 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  38.11 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  38.9 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  38.11 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.97 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  36.78 
 
 		 394 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  34.04 
 
 		 394 aa  189  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  34.63 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  34.56 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  38.06 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  35.44 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  36.62 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  36.25 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  37.66 
 
 		 548 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  37.3 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  36.22 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  37.43 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  37.32 
 
 		 550 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  36.92 
 
 		 548 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.19 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  37.07 
 
 		 550 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  37.07 
 
 		 550 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.92 
 
 		 387 aa  182  6e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  35.06 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  36.32 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  36.32 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  36.32 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  34.45 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  36.6 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  36.22 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.4 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>