More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3150 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  357  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  47.57 
 
 		 193 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  43.17 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  44.02 
 
 		 189 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  44.02 
 
 		 189 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  44.02 
 
 		 189 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  44.02 
 
 		 189 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  43.96 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  41.11 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  40.33 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  44.03 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  44.03 
 
 		 192 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  44.03 
 
 		 192 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  44.03 
 
 		 192 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  44.03 
 
 		 192 aa  141  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  44.03 
 
 		 192 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  44.03 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  44.03 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  44.03 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  39.23 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  40.98 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  43.04 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  41.08 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  42.16 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  41.14 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  42.22 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  42.41 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  41.98 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  42.41 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  41.72 
 
 		 206 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  41.07 
 
 		 212 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  40.51 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  35.91 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  36.81 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  36.26 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  36.26 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  33.53 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  35.67 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  35.29 
 
 		 198 aa  98.2  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  34.76 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  37.06 
 
 		 197 aa  95.5  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  34.09 
 
 		 204 aa  94.4  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  40.98 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  40.98 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  32.93 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  30.43 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  27.72 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  27.72 
 
 		 185 aa  84.3  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  27.17 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  30.2 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  32.14 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2694  inner membrane protein YohD  40 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  26.88 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  30.82 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  35.32 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  30.96 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  31.25 
 
 		 204 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  27.04 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  30.96 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  32.18 
 
 		 206 aa  72  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  31.47 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  27.27 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  30.96 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  31.28 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  31.28 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  31.28 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  31.28 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  31.72 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  30.46 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  30.41 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  31.28 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  29.14 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  31.28 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  31.36 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  29.23 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  23.42 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 229 aa  67  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  31.98 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.29 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  31.98 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  31.76 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  29.94 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  31.93 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  33.58 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  31.98 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  31.76 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  31.76 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 209 aa  64.3  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  30.34 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  28.66 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  28.66 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  30.14 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  31.08 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  31.08 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  30.41 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>