More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5918 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  86.76 
 
 
370 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  100 
 
 
370 aa  744    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  76.69 
 
 
370 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  73.51 
 
 
371 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  73.51 
 
 
371 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  73.51 
 
 
371 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  71.62 
 
 
371 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  73.24 
 
 
371 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  71.62 
 
 
371 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  71.08 
 
 
371 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  58.7 
 
 
370 aa  434  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  58.2 
 
 
368 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  59.02 
 
 
370 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  58.74 
 
 
368 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  57.38 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  58.47 
 
 
368 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.59 
 
 
369 aa  344  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.09 
 
 
372 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.68 
 
 
367 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.97 
 
 
372 aa  335  9e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.68 
 
 
374 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.68 
 
 
370 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.49 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.51 
 
 
380 aa  314  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.3 
 
 
389 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2228  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.59 
 
 
440 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.59 
 
 
443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.49 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1572  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.51 
 
 
461 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
284 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
277 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
290 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0345  dihydrolipoamide acetyltransferase  50.57 
 
 
450 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1026  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  47.37 
 
 
450 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
246 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
290 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.79 
 
 
437 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
312 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  26.61 
 
 
252 aa  94  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
290 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0317  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  48.91 
 
 
99 aa  94  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137506  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.44 
 
 
277 aa  93.6  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
314 aa  93.2  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
312 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
293 aa  92.8  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
279 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  31.54 
 
 
312 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
291 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  31.21 
 
 
276 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
291 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
291 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
288 aa  89.7  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 
273 aa  89.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
283 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
273 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.36 
 
 
315 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.36 
 
 
315 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
302 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
333 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
314 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
286 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  29.23 
 
 
286 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
421 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
283 aa  86.3  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
274 aa  86.3  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  30 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
268 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  24.7 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.82 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  27.39 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  27.78 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
302 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
350 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 
298 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.14 
 
 
288 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>