95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3844 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  100 
 
 
192 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  41.28 
 
 
181 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  36.78 
 
 
189 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
324 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 
228 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  29.49 
 
 
280 aa  61.6  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
238 aa  61.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  27.5 
 
 
240 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  33.59 
 
 
870 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  25.95 
 
 
296 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  24.82 
 
 
311 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  41.03 
 
 
400 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
324 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  25.2 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  25.74 
 
 
235 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  34.67 
 
 
244 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  28 
 
 
1124 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
222 aa  51.6  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
239 aa  49.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  22.1 
 
 
229 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0410  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
233 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  22.1 
 
 
229 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  22.1 
 
 
229 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
254 aa  48.5  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  24.41 
 
 
229 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  28.24 
 
 
224 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  26.32 
 
 
302 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.56 
 
 
851 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.56 
 
 
851 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  24.56 
 
 
851 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
511 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.56 
 
 
851 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.56 
 
 
851 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  46.34 
 
 
283 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
750 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 
507 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  46.34 
 
 
281 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  22.65 
 
 
229 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  50 
 
 
262 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  28.12 
 
 
488 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
266 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  36.21 
 
 
237 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.32 
 
 
853 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  21.55 
 
 
229 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  24.41 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  22.65 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  23.62 
 
 
229 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
238 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.44 
 
 
853 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  32.1 
 
 
222 aa  45.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  33.33 
 
 
668 aa  45.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  24.41 
 
 
229 aa  44.7  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.44 
 
 
853 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
544 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
573 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0534  hypothetical protein  31.82 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
996 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.88 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  28.17 
 
 
300 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  44.9 
 
 
1106 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  31.67 
 
 
230 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  32.05 
 
 
672 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  30.59 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
810 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 
240 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2547  glycosylase or SAM-dependent methyltransferase  37.78 
 
 
265 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.999348  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  23.62 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 
254 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  32.43 
 
 
237 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  38.03 
 
 
666 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  28.43 
 
 
291 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
415 aa  42  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.24 
 
 
258 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  32.39 
 
 
240 aa  42  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
219 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  34.57 
 
 
233 aa  42  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
303 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
223 aa  41.6  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  36.73 
 
 
267 aa  41.6  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
243 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
243 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
401 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
243 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  26.42 
 
 
233 aa  41.2  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
249 aa  41.2  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2351  Methyltransferase type 11  38 
 
 
270 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
305 aa  41.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  29.91 
 
 
309 aa  41.2  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
309 aa  41.2  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>