273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2409 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  100 
 
 		 334 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  71.91 
 
 		 325 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  61.11 
 
 		 294 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  49.38 
 
 		 329 aa  318  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  50.31 
 
 		 331 aa  308  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  49.84 
 
 		 330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  50.16 
 
 		 330 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 330 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  50 
 
 		 330 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 330 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  50.94 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  51.46 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  51.46 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  51.46 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  51.46 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  51.46 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  51.46 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  51.46 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  48 
 
 		 331 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  48.31 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  39.81 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  40.45 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  40.45 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  34.92 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  34.19 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  36.69 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  32.48 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  32.68 
 
 		 324 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  33.94 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  34.49 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  34.49 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  34.18 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  33.85 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  33.85 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  34.49 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  34.49 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  31.85 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  35.74 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  32.8 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  32.09 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  32.17 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  32.17 
 
 		 348 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  32.17 
 
 		 348 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  30.89 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  34.62 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  31.25 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  34.97 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  32.45 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  31.07 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  30.19 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  27.41 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  30.59 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  28.42 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  30.11 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  30.36 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  28.81 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  27.63 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  30.49 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.32 
 
 		 676 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  32.21 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  32 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  29.7 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  30.06 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.47 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  31.93 
 
 		 232 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0174  alkaline phosphatase  24.87 
 
 		 206 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  29.7 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  28.92 
 
 		 224 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  29.88 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0395  SNARE associated Golgi protein  25.38 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  27.98 
 
 		 219 aa  53.9  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  31.5 
 
 		 159 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  32.52 
 
 		 217 aa  53.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.27 
 
 		 215 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  23.12 
 
 		 208 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  33.01 
 
 		 198 aa  52.8  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  29.7 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0530  dedA family protein  25.71 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  32.06 
 
 		 200 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  29.59 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0402  SNARE associated Golgi protein  24.75 
 
 		 198 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  27.33 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  23.93 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  27.33 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0531  dedA family protein  25.71 
 
 		 198 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  27.33 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  30.36 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.68 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.65 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0480  dedA family protein  24.86 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  28.05 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  29.24 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  28.38 
 
 		 205 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>